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地图3k7丝裂原活化蛋白激酶激酶7[小家鼠(家鼠)]

基因ID:26409,更新日期2024年9月18日

总结

官方符号
地图3k7由提供MGI公司
官方全名
丝裂原活化蛋白激酶激酶7由提供MGI公司
主要来源
MGI:MGI:1346877
请参阅相关
乐团:ENSMUSG00000028284 联盟基因组:MGI:1346877
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;Euarchontoglires语;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
也称为
Tak1;B430101B05型
总结
启用酶激活剂活性;蛋白激酶活性;受体酪氨酸激酶结合活性。涉及多个过程,包括JNK级联;失巢症;坏死过程的负调控。作用于多个过程的上游或内部,包括细胞内信号转导;信号转导调控;以及管的形态发生。位于突触后密度。表达于多种结构,包括中枢神经系统;肠道;后肾;生殖系统;和呼吸系统。用于研究Wolff-Parkinson-White综合征。该基因的人类直系同源基因与第二额骨发育不良和前列腺癌有关。与人类MAP3K7同源(丝裂原活化蛋白激酶激酶7)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
表达式
CNS E11.5(RPKM 14.7)、肢体E14.5(RPKM14.0)和28个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
新款
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

请参见中的Map3k7基因组数据查看器
位置:
4 A5;4 13.91立方厘米
外显子计数:
17
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 4 NC_000070.7(31963659..32023470)
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(合同通用条款000001635.26) 4 NC_000070.6(31963492..32023470)

染色体4-NC_000070.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene predicted gene, 42315 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09843 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09845 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09846 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09848 Neighboring gene predicted gene, 32412 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09849 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E6156 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09851 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09853 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09854 Neighboring gene predicted gene, 26254 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E7958 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E10228 Neighboring gene predicted gene 11927 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09855 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr4:32251946-32252191 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09857 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_09858 Neighboring gene predicted gene, 42266

基因组区域、转录物和产物

表达式

  • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目:PRJNA66167型
  • 出版物:PMID 25409824
  • 分析日期:无

参考文献

PubMed中的相关文章

GeneRIFs:功能的基因引用

什么是GeneRIF?

变更

等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

PubChem的途径

互动

产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

一般基因信息

标记

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
启用ATP绑定 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
启用ATP绑定 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用DNA-结合转录因子结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用MAP激酶活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用MAP激酶活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
启用MAP激酶激酶活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
启用MAP激酶激酶活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用MAP激酶激酶活性 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
启用MAP激酶激酶激酶活性 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
激活组蛋白激酶活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
实现相同的蛋白质结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
启用线性多泛素结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使镁离子结合 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
激活蛋白丝氨酸激酶活性 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
 
激活蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
激活蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
使蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶具有活性 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
激活蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 TAS公司
可追溯作者声明
更多信息
 
使蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使受体酪氨酸激酶结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
公共医学 
使受体酪氨酸激酶结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使支架蛋白结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
公共医学 
启用转录辅激活子结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使II型转化生长因子β受体结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
使泛素蛋白连接酶结合 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
过程 证据代码 酒吧
actits_upstream_of_or_within I-kappaB磷酸化 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
参与I-kappaB磷酸化 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与I-kappaB磷酸化 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
involved_in JNK级联 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
involved_in JNK级联 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
JNK级联的acts_upstream_of IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
involved_in JNK级联 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
acts_upstream_of_or_within MAPK级联 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
involved_in MAPK级联 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
involved_in MAPK级联 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
血管生成中的上游行为 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
涉及失巢症 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
凋亡信号通路上游的acts IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
凋亡信号通路上游的acts 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与骨骼发育 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与典型NF-kappaB信号转导 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
血管紧张素参与细胞反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
转化生长因子β刺激参与细胞反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
肿瘤坏死因子参与细胞反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细菌防御反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与免疫反应 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与炎症反应 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与白细胞介素-17A介导的信号通路 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
白细胞介素-33介导的信号通路参与 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
acts上游of或在凋亡信号通路的负调控中 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
acts上游of或在凋亡信号通路的负调控中 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与基因表达的负调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与坏死过程的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与活性氧代谢过程的负调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
acts_upstream_of_or参与坏死过程的内下垂小体组装负调控 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
神经管形成中的上游动作 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与成骨细胞分化 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与p38MAPK级联 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
acts_upstream_of_or_within JNK级联的正调节 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
参与JUN激酶活性的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与JUN激酶活性的正调控 国际空间站
根据序列或结构相似性推断
更多信息
 
参与MAPK级联的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与T细胞细胞因子产生的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与自噬的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与cGAS/STING信号通路的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与典型NF-kappaB信号转导的正调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
 
参与典型NF-kappaB信号转导的正调控 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
公共医学 
参与典型NF-kappaB信号转导的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞周期的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与细胞大小的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与白细胞介素2产生的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与宏观自噬的正调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与非规范NF-kappaB信号转导的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与血管相关平滑肌细胞迁移的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
参与血管相关平滑肌细胞增殖的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
蛋白质磷酸化中的上游作用 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
参与蛋白磷酸化 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
公共医学 
acts上游of或活性氧代谢过程中的调节 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 
参与应激激活的MAPK级联 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
toll-like受体4信号通路的参与 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
 
acts上游of或转化生长因子β受体信号通路内 进口
根据突变表型推断
更多信息
公共医学 

一般蛋白质信息

首选名称
丝裂原活化蛋白激酶激酶7
姓名
TGF-β活化激酶1
转化生长因子β活化激酶1
NP_033342.1号
NP_766276.1号
XP_006538011.1号

NCBI参考序列(RefSeq)

新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_009316.1号NP_033342.1号丝裂原活化蛋白激酶激酶7亚型B

    参见NP_033342.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:该变体(B)代表较长的转录,编码较长的亚型(B)。
    源序列
    AK137046、AL833781、CV559615
    共识CDS
    邮编:51133.1
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TXG1号,Q923A8问题
    相关的
    ENSMUSP000000040307.5,ENSMUST00000037607.11号
    保守领域(1)总结
    cd14058
    位置:42292
    STKc_TAK1;丝氨酸/苏氨酸激酶的催化域,转化生长因子β活化激酶-1
  2. NM_172688.3NP_766276.1型丝裂原活化蛋白激酶激酶7亚型A

    参见NP_766276.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态:已验证

    描述
    转录变体:与变体B相比,该变体(A)缺少帧内编码片段。与亚型B相比,生成的亚型(A)缺乏内部区域。
    源序列
    AK137046,AL833781
    共识CDS
    CCDS18014.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    Q62073问题
    UniProtKB/TrEMBL公司
    Q3TXG1号,问题543B5
    相关的
    ENSMUSP00000079734.7号,ENSMUST00000080933.13号
    保守领域(1)总结
    cd14058
    位置:42292
    STKc_TAK1;丝氨酸/苏氨酸激酶的催化域,转化生长因子β活化激酶-1

注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000070.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    31963659..32023470
    下载
    GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

mRNA和蛋白质

  1. XM_006537948.4号XP_006538011.1型丝裂原活化蛋白激酶激酶7亚型X1

    保守领域(1)总结
    第21453条
    位置:1162
    PKc_like;蛋白激酶,催化结构域

核糖核酸

  1. XR_390323.5号RNA序列

  2. 学而思_004941909.1RNA序列

  3. XR_004941907.1号RNA序列

  4. XR_004941908.1号RNA序列