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Plxnb2型丛蛋白B2[小家鼠（家鼠）]

基因ID:140570，更新日期2024年9月18日

总结

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官方符号
Plxnb2型由提供MGI公司
官方全名
丛蛋白B2由提供MGI公司
主要来源
管理机构：管理机构：2154239
请参阅相关
乐团：ENSMUSG00000036606 联盟基因组：MGI:2154239
基因类型
蛋白质编码
RefSeq状态
已验证
有机体
小家鼠
血统
真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；Euarchontoglires语；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；穆斯；穆斯
也称为
债务；丛蛋白B2
总结
启用信号素受体活动。参与多个过程，包括神经系统发育；神经元迁移调控；和信号转导途径。作用于轴突发生的正向调控的上游或内部。是质膜的组成部分。以多种结构表达，包括消化系统；脑；泌尿生殖系统；呼吸系统；和感觉器官。与人PLXNB2同源（丛蛋白B2）。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式
结肠成体（RPKM 85.9）、卵巢成体（RTKM 65.3）和28个其他组织中普遍表达查看更多
直系同源
人类 全部的
新的
尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

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参见中的Plxnb2基因组数据查看器
地点：
15 E3；15 44.68立方厘米
外显子计数：
41
注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 15 NC_000081.7（89039752..89064960，补码）
108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(合同通用条款000001635.26) 15 NC_000081.6（89155546..89182018，补遗）

染色体15-NC_000081.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E8605 Neighboring gene mitogen-activated protein kinase 12 Neighboring gene mitogen-activated protein kinase 11 Neighboring gene microRNA 7118 Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_39459 Neighboring gene DENN domain containing 6B Neighboring gene microRNA 6958 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E3151 Neighboring gene STARR-positive B cell enhancer ABC_E4146 Neighboring gene protein phosphatase 6, regulatory subunit 2 Neighboring gene SET binding factor 1

基因组区域、转录物和产物

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表达式

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  • 项目名称：鼠标ENCODE转录组数据鼠标ENCODE转录组数据
  • 描述：鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
  • 生物项目：PRJNA66167型
  • 出版物：PMID 25409824
  • 分析日期：无

参考文献

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PubMed中的相关文章

  1. 突变的轴突导向基因PLXNB2维持从未知原发性癌症中分离的干细胞的生长和侵袭性。 布伦杜S，等EMBO Mol Med，2023年3月8日。PMID 36722641，免费PMC文章
  2. 胶质受体PLXNB2通过杏仁核调节精神分裂症相关的应激感受。 佛罗里达州宣市，等《Front Immunol》，2022年。PMID 36325348，免费PMC文章
  3. Plexin-B2调节出生后和成年脑室下区成神经细胞的增殖和迁移。 萨哈B，等《神经科学杂志》，2012年11月21日。PMID 23175841，免费PMC文章
  4. 巨噬细胞通过Plexin-B2组织再生轨迹，促进周围神经再生。 李毅，等《基因开发》，2022年2月1日。PMID 35086862，免费PMC文章
  5. 破骨细胞通过血管生成素/丛蛋白B2轴保护骨血管免受衰老。 刘X，等《国家通讯》，2021年3月23日。PMID 33758201，免费PMC文章

查看PubMed中的所有（82）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？
  1. 体内相互作用筛选揭示了肝脏对转移的限制。
    标题：体内相互作用筛选揭示了肝脏对转移的限制。
  2. 通过Sema4B-Plexin-B2的星形胶质细胞与小胶质细胞的通讯调节小胶质细胞损伤诱导的反应性。
    标题：星形胶质细胞通过Sema4B-Plexin-B2与小胶质细胞的通讯调节小胶质细胞损伤诱导的反应性。
  3. 突变的轴突导向基因PLXNB2维持从未知原发性癌症中分离的干细胞的生长和侵袭性。
    标题：突变的轴突引导基因PLXNB2维持从未知原发性癌症中分离的干细胞的生长和侵袭性。
  4. 胶质受体PLXNB2通过杏仁核调节精神分裂症相关的应激感受。
    标题：神经胶质受体PLXNB2通过杏仁核调节精神分裂症相关的压力感受。
  5. Plexin-B2控制小脑颗粒神经元的分化时间和运动。
    标题：Plexin-B2控制小脑颗粒神经元的分化时间和运动。
  6. 信号素4C/Plexin-B2信号通过神经元和突触形态重塑对恐惧记忆的影响。
    标题：信号素4C/Plexin-B2信号转导通过神经元和突触形态重塑对恐惧记忆的影响。
  7. 破骨细胞通过血管生成素/丛蛋白B2轴保护骨血管免受衰老。
    标题：破骨细胞通过血管生成素/丛蛋白B2轴保护骨血管免受衰老。
  8. 髓样细胞通过血管生成素/丛蛋白B2轴保护肠上皮屏障的完整性。
    标题：髓样细胞通过血管生成素/丛蛋白B2轴保护肠上皮屏障的完整性。
  9. Plexin B2是单核细胞凋亡细胞分解的调节因子。
    标题：Plexin B2是单核细胞凋亡细胞分解的调节器。
  10. Plexin-B2是创伤愈合过程中整合损伤激活小胶质细胞的生化线索和物理相互作用以及与损伤微环境的重要环节
    标题：小胶质细胞和巨噬细胞通过Plexin-B2促进脊髓损伤后的圈养、创伤压实和恢复。
提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GenerRIF（26）

变更

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等位基因

这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载（MGI）
  • 化学诱导（ENU）（1）
  • 核酸内切酶介导（2）1个引文
  • 捕获的基因（1）
  • 目标（5）1条引文

互动

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产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 描述

一般基因信息

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标记

同源性

克隆名称

  • mKIAA0315，1110007H23Rik公司

基因本体论 由MGI提供

功能 证据代码 酒吧
实现蛋白质结合 IPI公司
从物理相互作用推断
更多信息
 公共医学 
启用信号素受体活性 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
使信号素受体具有活性 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
激活跨膜信号受体活性 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
过程 证据代码 酒吧
参与大脑发育 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与兴奋性突触装配 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
通过质膜粘附分子参与嗜同性细胞粘附 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
通过质膜粘附分子参与嗜同性细胞粘附 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与细胞粘附的负调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
涉及神经管闭合 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与成神经细胞增殖 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与轴突发生的正调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
acts_upstream_of_or在轴突发生的正调控中 IGI公司
从遗传相互作用推断
更多信息
 公共医学 
参与神经元投射发育的正调控 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与神经元投射发育的正调控 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与翻译的积极调节 国际能源署
从电子注释推断
更多信息
  
参与翻译的积极调节 国际标准化组织
从序列正畸学推断
更多信息
  
参与GTPase活性的调节 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与细胞迁移的调控 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与细胞形状的调节 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与细胞形状的调节 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与神经元迁移的调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与蛋白质磷酸化的调控 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与信号转导通路 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
参与信号转导通路 进口
根据突变表型推断
更多信息
 公共医学 
参与突触组装 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
组件 证据代码 酒吧
含有胶原蛋白的细胞外基质 HDA公司 公共医学 
血浆中的is_active 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  
定位于质膜 国际开发协会
根据直接分析推断
更多信息
 公共医学 
部分信号素受体复合物 国际律师协会
从祖先的生物学角度推断
更多信息
  

一般蛋白质信息

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首选名称
丛蛋白B2
姓名
脑肿瘤中的差异表达

NCBI参考序列（RefSeq）

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新的 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

  1. NM_001159521.3→NP_001152993.1号丛蛋白B2亚型1前体

    参见NP_001152993.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    描述
    成绩单变体：该变体（1）代表最长的成绩单。变体1-3编码相同的蛋白质。
    源序列
    AC113069、AC160538
    共识CDS
    累计49698.1
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型
    保守领域（7）总结
    cd01179号
    地点：898→984
    IPT_plexin_repeat2；Plexins和细胞表面受体（PCSR）IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖以及细胞粘附和排斥受体的调节。通常，存在三个IPT域副本。。。
    cd01180号
    地点：806→897
    IPT_plexin_repeat1；Plexins和细胞表面受体（PCSR）IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖以及细胞粘附和排斥受体的调节。通常，存在三个IPT域副本。。。
    第01437页
    地点：471→519
    PSI；Plexin重复
    pfam08337型
    地点：1275→1809
    Plexin_cytopl；Plexin细胞质RasGAP结构域
    pfam17960型
    地点：528→615
    TIG_plexin；TIG域
    第15674条
    地点：986→1069
    IPT；免疫球蛋白样折叠，丛蛋白，转录因子（IPT）。IPT也称为转录因子免疫球蛋白（TIG）域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体（如丛蛋白和分散因子。。。
    第15693条
    地点：27→469
    塞马；语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域

  2. NM_001284506.2号→NP_001271435.1号丛蛋白B2亚型1前体

    参见NP_001271435.1的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    描述
    转录变体：与变体1相比，该变体（3）在5'UTR中有所不同。变体1-3编码相同的蛋白质。
    源序列
    交流电113069、交流电160538
    共识CDS
    CCDS49698.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型
    相关的
    ENSMUSP000000051731.10,ENSMUST00000060808.10号
    保留域（7）总结
    cd01179号
    地点：898→984
    IPT_plexin_repeat2；Plexins和细胞表面受体（PCSR）IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖以及细胞粘附和排斥受体的调节。通常，存在三个IPT域副本。。。
    cd01180号
    地点：806→897
    IPT_plexin_repeat1；Plexins和细胞表面受体（PCSR）IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖以及细胞粘附和排斥受体的调节。通常，存在三个IPT域副本。。。
    第01437页
    地点：471→519
    PSI；Plexin重复
    pfam08337型
    地点：1275→1809
    Plexin_cytopl；Plexin细胞质RasGAP结构域
    pfam17960型
    地点：528→615
    TIG_丛蛋白；TIG域
    第15674条
    地点：986→1069
    IPT；免疫球蛋白样折叠，丛蛋白，转录因子（IPT）。IPT也称为转录因子免疫球蛋白（TIG）域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体（如丛蛋白和分散因子。。。
    第15693条
    地点：27→469
    塞马；语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域

  3. NM_001416425.1→NP_001403354.1号丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069、AC160538
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型

  4. NM_001416426.1→NP_001403355.1号丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069、AC160538
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型

  5. NM_001416427.1→NP_001403356.1号丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069、AC160538
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型

  6. NM_001416428.1→NP_001403357.1号丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069、AC160538
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型

  7. NM_001416429.1→NP_001403358.1号丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069、AC160538
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型

  8. NM_001416430.1→NP_001403359.1号丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    交流电113069、交流电160538
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型

  9. NM_001416431.1号→NP_001403360.1丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069、AC160538
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型

  10. NM_001416432.1→NP_001403361.1号丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    交流电113069
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型

  11. NM_001416433.1号→NP_001403362.1号丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069型
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型

  12. NM_001416434.1→NP_001403363.1号丛蛋白B2亚型1前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069型
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4,Q3UH76型

  13. NM_001416435.1→NP_001403364.1号丛蛋白B2亚型2前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069、AC160538

  14. 纳米_001416436.1→NP_001403365.1号丛蛋白B2亚型3前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069、AC160538

  15. NM_001416437.1→NP_001403366.1号丛蛋白B2亚型4前体

    状态：已验证

    源序列
    AC113069、AC160538

  16. NM_138749.4→NP_620088.2号丛蛋白B2亚型1前体

    参见NP_620088.2的相同蛋白质及其注释位置

    状态：已验证

    描述
    转录变体：与变体1相比，该变体（2）在5'UTR中有所不同。变体1-3编码相同的蛋白质。
    源序列
    AC113069、AC160538
    共识CDS
    CCDS49698.1号文件
    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型
    相关的
    ENSMUSP00000104955.2公司,ENSMUST00000109331.9号
    保守领域（7）总结
    cd01179号
    地点：898→984
    IPT_plexin_repeat2；Plexins和细胞表面受体（PCSR）IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖以及细胞粘附和排斥受体的调节。通常，IPT域有三个副本。。。
    cd01180号
    地点：806→897
    IPT_plexin_repeat1；Plexins和细胞表面受体（PCSR）IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖以及细胞粘附和排斥受体的调节。通常，存在三个IPT域副本。。。
    第01437页
    地点：471→519
    PSI；Plexin重复
    pfam08337型
    地点：1275→1809
    Plexin_cytopl；Plexin细胞质RasGAP结构域
    pfam17960型
    地点：528→615
    TIG_丛蛋白；TIG域
    第15674条
    地点：986→1069
    IPT；免疫球蛋白样折叠，丛蛋白，转录因子（IPT）。IPT也称为转录因子免疫球蛋白（TIG）域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体（如丛蛋白和分散因子。。。
    第15693条
    地点：27→469
    塞马；语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域

注释基因组的参考序列：GCF_000001635.27-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCm39 C57BL/6J

基因组学

  1. NC_000081.7参考GRCm39 C57BL/6J

    范围
    89039752..89064960补码
    下载
    GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

  1. XM_030248318.2号→XP_030104178.1号丛蛋白B2亚型X1

    UniProtKB/Swiss-Prot公司
    B2RXS4型,Q3UH76型
    保守领域（7）总结
    cd01179号
    地点：898→984
    IPT_plexin_repeat2；Plexins和细胞表面受体（PCSR）IPT结构域的第二个重复序列。Plexins参与细胞增殖以及细胞粘附和排斥受体的调节。通常，存在三个IPT域副本。。。
    cd01180号
    地点：806→897
    IPT_plexin_repeat1；Plexins和细胞表面受体（PCSR）IPT结构域的第一个重复。Plexins参与细胞增殖以及细胞粘附和排斥受体的调节。通常，存在三个IPT域副本。。。
    第01437页
    地点：471→519
    PSI；Plexin重复
    pfam08337型
    地点：1275→1809
    Plexin_cytopl；Plexin细胞质RasGAP结构域
    pfam17960型
    地点：528→615
    TIG_plexin；TIG区域
    第15674条
    地点：986→1069
    IPT；免疫球蛋白样折叠，丛蛋白，转录因子（IPT）。IPT也称为转录因子免疫球蛋白（TIG）域。它们存在于细胞内转录因子、细胞表面受体（如丛蛋白和分散因子。。。
    第15693条
    地点：27→469
    塞马；语义蛋白和丛蛋白的蛋白质相互作用模块Sema域
核苷酸 蛋白质 应变
标题 访问和版本
蛋白质接入 链接
GenPept链接 UniProtKB链接
B2RXS4.1协议 GenPept公司 UniProtKB/瑞士Prot:B2RXS4

基因链接输出

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其他文献来源
化学信息
分子生物学数据库
研究材料
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