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搜索摘要

搜索条件

修改搜索

搜索结果

关联结果  正在检索。。。  不适用
基因  正在检索。。。  通过基因名称和/或基因ID进行搜索。
单核苷酸多态性  正在检索。。。  通过从基因搜索中检索到的基因符号进行搜索。
eQTL数据  正在检索。。。  不适用
dbGaP研究  正在检索。。。 根据关联结果第1页检索到的特征进行搜索。
基因组视图  正在检索。。。 
修改搜索 全部显示 全部隐藏

获取信息。搜索条件

表型选择获取信息。

特点:
小于1 x 10 - 资料来源:

基因型选择获取信息。

染色体:
(从:到)
基因名称或ID:
SNP编号:
SNP功能类
清除使转化
隐藏显示
使用下面的控件输入搜索条件。使用左侧的标签或箭头隐藏/显示任何部分。每个节标题最右侧的小箭头用于将节移动到相邻节的上方或下方。
输入任何特征或疾病的名称,将出现一个窗口,其中包含建议列表。目前,表型与准确的MeSH术语相匹配;父级、子级和同义词未编入索引。如果希望按类别缩小搜索范围,请单击浏览。。。按钮。当选择了多个特征时,搜索结果将包括与任何选定特征匹配的记录。您还可以将关联结果和eQTL数据的P值限制为小于指定值。
选择广泛特征类别以限制特征选择中显示的项目。
选择要搜索的特征。选择一个特性将限制上述特性类别。
所示数据是根据NHGRI GWAS目录(来源=NHGRI)和提交给dbGaP的分析中最重要的点击数编译而成的。
显示的数据是与搜索条件匹配的选定列,直接来自NCBI基因。
显示的数据是与搜索条件匹配的选定列,直接从Entrez-dbSNP获取。
显示的数据是与搜索条件匹配的选定列,直接从NCBI的GTEx数据库和浏览器中获取。该数据库旨在提供一个中心资源,用于存档和显示遗传变异与高通量分子水平表型之间的关联。这一努力源于NIH GTEx路线图项目;然而,该资源的范围将扩展到包括任何可用的基因型/分子表型数据集。
显示的数据是通过匹配搜索标准从NCBI molQTL资源(即将推出)中提取的分子QTL数据集。
显示的数据是与关联结果中的特征信息相关的选定dbGaP研究信息。每个研究名称都超链接到相应的dbGaP研究页面,用户可以在该页面申请对个人级别数据的授权访问。
显示搜索中指定的所有基因组位置的象形图视图,这些基因组位置跨越具有SNP和基因结果的区域。

方向可以选择为垂直、水平,也可以使用默认方向。如果显示一条染色体,则默认为水平,否则为垂直。

用户可以选择在显示屏中包含SNP和/或基因。如果搜索条件包括位置,也可以显示该位置。

“显示”选项是页面上显示的SNP和基因的当前子集(例如,1/50,75)或所有关联结果中的结果(例如,全部75),包括“关联结果”表当前页面中未显示的内容。由于潜在的数据量,只有在初始搜索中选择表型性状时,后一选项才可用。
遗传位置可以通过以下三种方式之一指定:
  1. 位置:染色体和范围(染色体上的位置)
    范围由空格、连字符或逗号以多种格式指定为两个数字。以下示例是等效的:
    1000000:10000000
    100万到1000万
    10万K 10万K
  2. 基因:一个或多个基因符号或NCBI基因ID,由空格、逗号或单独的行分隔。
  3. SNP公司:一个或多个dbSNP rs数字,由空格、逗号或单独的行分隔。'rs'前缀是可选的。

您可以选择一个或多个SNP函数类。如果没有选择,则包括所有函数类,包括“intergenic”
如果在表型选择中选择了类别和/或性状,则整个部分是可选的。
类别:
可用特征:清除使转化
所选特征:

获取信息。基因

未找到基因数据。
修改搜索{“section”:“GENE”,“summary”:“找不到数据。”,“重新启动”:0,“页面大小”:50,“计数”:0,“序列”:{“chr”:[],“标记”:{},“未映射”:[]}}

获取信息。基因组视图

象形字设置获取信息。

方向:
包括:    
显示:
染色体:
更新下载
总结
SNP公司基因计数位置bps
SNP符号基因符号1个SNP或基因位置符号小于2M bps
SNP符号基因符号2-10个SNPs或基因位置符号至少200万bps
SNP符号基因符号11-20个SNP或基因 
SNP符号基因符号超过20个SNP或基因
正在创建表意文字。。。
单击象形图注释以显示序列显示
找不到数据。

获取信息。关联结果

找不到关联数据。
修改搜索{“section”:“assoc”,“summary”:“找不到数据。”,“网格”:[],“基因”:[],“snps”:[],“页面”:“”,“call”:“BuildGaP”,“pageSize”:“”,“recCount”:“”}

获取信息。单核苷酸多态性

未找到SNP数据。
修改搜索{“section”:“SNP”,“summary”:“找不到数据。”,“基因”:[],“重新启动”:0,“pageSize”:50,“计数”:0,“序列”:{“chr”:[],“标记”:{},“未映射”:[]}}

获取信息。eQTL数据

未找到eQTL数据。
修改搜索{“章节”:“gtex”,“summary”:“数据错误。”,“错误”:1,“基因”:[],“snps”:[],“页面”:1,“pageSize”:50,“recCount”:0}