保守蛋白结构域家族
LEM_Man1型

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cd12942:LEM_Man1型
内核膜蛋白Man1中发现的LEM(Lap2/Emerin/Man1)结构域
该CD对应于Man1和类似蛋白质的LEM结构域。Man1,也称为LEM域包含蛋白3(LEMD3),是内核膜的一种完整蛋白质,与核层粘连和emerin结合,从而在核组织中发挥作用。它是染色质组织和细胞分裂所必需的蛋白质复合体的一部分。它还通过与染色质相关蛋白和转录调节剂(包括R-Smads、Smad1、Smad2和Smad3)直接相互作用,对转化生长因子β(TGF-β)/激活素/结节信号通路和骨形态发生蛋白(BMP)信号通路发挥重要的负调控作用。Man1是一种独特的左/右(LR)信号调节器,作用于内核膜。此外,Man1在血管生成中起着关键作用。血管重构可以通过Man1和Smads之间的相互作用在内核膜上进行调节。Man1包含一个N末端LEM结构域、两个假定的跨膜结构域、一个Man1-Src1p C末端(MSC)结构域和一个C末端RNA识别基序(RRM),也称为RBD(RNA结合结构域)或RNP(核糖核蛋白结构域)。LEM结构域与DNA和染色质结合蛋白Barrier-to-Automintegration Factor相互作用,并且对于Man1在内核膜中的有效定位也是必要的。已有研究表明,Man1的C末端核质区显示出一个DNA结合翼螺旋结构域,并负责DNA和Smad结合。
链接
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资料来源: cd12934型
分类: 真造口术
公共医学: 13个链接
蛋白质: 代表
特异性蛋白质
相关蛋白质
相关结构
体系结构
超级家族: 第02649条
统计
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PSSM-Id: 240589
对齐的: 4行
阈值位分数: 94.7787
创建: 2012年2月15日
更新时间: 2020年10月2日
结构
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对齐的行:
 
假定的
特征1:假定的多肽底物结合位点[多肽结合位点]
证据:
  • 备注:基于结构证据,人类emerin结合屏障-自动整合因子(BAF)。
  • 引用:PMID 17355960

序列对齐
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格式: 行显示: 颜色位: 类型选择:
功能1###############
Q9Y2U8号       8A类P(P)L(左)S公司D类E类E类L(左)F类S公司L(左)R(右)R(右)Y(Y)G公司L(左)S公司P(P)G公司P(P)T型E类S公司T型R(右)P(P)Y(Y)L(左)K(K)K(K)L(左)K(K)K(K)L(左)R(右)E类E类E类 51 人类
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NP_001038329号 2A类S公司A类L(左)T型D类E类E类L(左)S公司E类L(左)K(K)R(右)L(左)G公司F类T型P(P)G公司P(P)T型E类S公司T型R(右)P(P)Y(Y)L(左)K(K)K(K)L(左)K(K)K(K)L(左)R(右)E类E类P(P) 45 斑马鱼
NP_001082578号 2A类A类A类L(左)T型D类E类E类L(左)F类S公司E类L(左)K(K)R(右)S公司G公司M(M)P(P)G公司P(P)T型D类S公司T型R(右)P(P)Y(Y)L(左)K(K)K(K)L(左)K(K)K(K)L(左)R(右)E类E类R(右) 45 非洲爪蟾

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