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胶质纤维酸性蛋白亚型1[智人]

蛋白质分类

中间丝族蛋白(域体系结构ID 12057329)

中间丝族蛋白类似于结蛋白,结蛋白是一种肌肉特异性III型中间丝,对肌肉的正常结构和功能至关重要

图形摘要

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姓名 加入 描述 间隔 E值
长丝 pfam00038型
中间丝蛋白;
68-376 2.58电子-127

中间丝蛋白;


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Pssm-ID:459643[多域]Cd长度:313  比特分数:370.40  E值:2.58电子-127
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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
4-66 4.27e-08年

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


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中间丝蛋白;
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中间丝蛋白;


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
85-375 4.32e-13段

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:71.51  E值:4.32e-13段
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吉4503979  325电子美国铝业公司A类R(右)LEEE公司GQS公司L(左)KDEM公司A类右侧L(左)电子YQD公司L(左)LNVKLA公司L(左)设计院电子A类TYRKL公司L(左)EGEEN公司 375
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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
85-378 4.93e-10条

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:61.61  E值:4.93e-10条
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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
4-66 4.27e-08年

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


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PRK02224号 PRK02224号
DNA双链断裂修复;Rad50-ATPase;
117-344 5.63e-05年

DNA双链断裂修复;Rad50-ATPase;


Pssm-ID:179385[多域]Cd长度:880  比特分数:45.42  E值:5.63e-05年
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吉4503979   117质量保证电致发光重新L(左)RLRLDQ公司L(左)TANS公司A类右心室电子V(V)急诊室DN(公称直径)洛杉矶QDLA电视R(右)QK公司L(左)QDETNL公司R(右)LEANNLAAYRQE公司A类DEATLA公司R(右)劳埃德LE公司RKI公司电子S公司L(左)电子电气设备 196
合同编号:PRK02224 250重新电致发光电子技师L(左)EAEIED公司L(左)RETI公司A类电子技师电子R(右)急诊室电气工程师洛杉矶欧洲VRDLR(右)急诊室L(左)EELEEE公司R(右)DDLLAEAGLDDAD公司A类EAVEAR公司R(右)电气工程师LE公司DRD公司电子电子L(左)雷达雷达 329
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吉4503979   197红外荧光灯R(右)---KI公司H(H)电子电气工程师VRE公司L(左)电子QLAR公司-----QQVHV公司电子LDVAKPD公司L(左)助教A类LKEIRTQY公司电子AMAS公司MH公司电子不良事件电子R(右)SK公司F类A类D类LTDAA公司 268
合同编号:PRK02224 330LEEC公司R(右)vaa公司质量保证H(H)N个电气工程师AES公司L(左)R(右)电子DADD公司视差EELRE公司电子AAELESE公司L(左)电气工程师A类铰刀电子环境影响评价--LE公司电子工程安装电子电致发光R(右)急诊室F类G公司D类APVDL公司 407
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吉4503979   339杜兰特电子宗教硕士 344
合同编号:PRK02224 488电气工程师电子VEE公司 493
 
姓名 加入 描述 间隔 E值
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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
85-375 4.32e-13段

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
90-377 5.50e-12号机组

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
85-378 4.93e-10条

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
63-362 6.69e-10

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


Pssm-ID:440809[多域]Cd长度:983  比特分数:61.49  E值:6.69e-10
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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
86-375 1.27e-09

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
68-314 1.63e-09年

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:60.07  E值:1.63e-09年
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环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
117-348 1.57e-08年

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


Pssm-ID:443969[多域]Cd长度:377  比特分数:56.31  E值:1.57e-08年
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灯丝_头 pfam04732型
中间丝头(DNA结合)区;这个系列代表N端子头。。。
4-66 4.27e-08年

中间丝头(DNA结合)区;该家族代表中间丝的N末端头部区域。中间丝头结合DNA。波形蛋白头部能够改变核结构和染色质分布,HIV-1蛋白酶释放的头部释放可能在HIV-1相关的细胞病变和致癌中发挥重要作用。头部区域的磷酸化会影响灯丝的稳定性。头部与同一蛋白质的杆状结构域相互作用。


Pssm-ID:461414[多域]Cd长度:83  比特分数:50.08  E值:4.27e-08年
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环境委员会 合同编号4942
隔环因子EnvC,鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB[细胞周期控制。。。
54-273 9.65e-08年

隔环因子EnvC、鼠蛋白水解酶激活剂AmiA和AmiB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


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SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
63-344 2.86e-06

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274009[多域]Cd长度:1164  比特分数:49.68  E值:2.86e-06
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合同编号:TIGR02169 823R(右)L(左)TLEKEYLEKEI公司ELQEQ公司R(右)IDLKEQIKSIEK公司电子国际能源网络-------L(左)天然气K(K)K(K)电子电子LEEE公司L(左)----EEL公司电子AAL公司R(右)D类L(左)电子自旋共振L(左)G公司------ 885
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合同编号4913 合同编号4913
未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];
114-354 8.72e-06年

未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];


Pssm-ID:443941[多域]Cd长度:1089  比特分数:48.37  E值:8.72e-06年
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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
62-259 1.13e-05

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:47.74  E值:1.13e-05
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合同编号4913 合同编号4913
未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];
70-308 2005年1月14日

未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];


Pssm-ID:443941[多域]Cd长度:1089  比特分数:47.60  E值:2005年1月14日
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吉4503979  146QDLATVRQK公司L(左)QDETNLRL公司电子美国运通银行L(左)A类A类YRQE公司A类DEATL公司A类R(右)L(左)德勒基斯莱伊R(右)F类左后基赫电气工程师EVRE公司L(左)量化宽松政策L(左)A类R(右)QQVHV公司电子L(左)- 224
抄送:COG4913 713盖格列克L(左)EQAEELD公司电子LQDR公司L(左)电子A类AEDL公司A类RLELR公司A类L(左)L(左)EERFAAALGDAVE公司R(右)电子左后ENL公司电气工程师RIDA公司L(左)风险调整比率L(左)N个R(右)AEEEL公司电子R(右) 792
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抄送:COG4913 793mrafnrew先生帕埃塔分力D类A类D类L(左)ESLP公司-电子Y(Y)L(左)A类L(左)低密度脂蛋白EEDGLP公司电子Y(Y)电气工程师----R(右)F类韩国L(左)LNENSIE公司功能性车辆A类D类陆上通信线SKLRAIREIKERID公司 867
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吉4503979  291S公司L(左)tcdleslrgt公司N个电子SL公司电子R(右) 308
抄送:COG4913 868P(P)L(左)----------N个D类SL公司K(K)R(右) 875
SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
63-333 2.69电子-05

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274008[多域]Cd长度:1179  比特分数:46.59  E值:2.69电子-05
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吉4503979    63K(K)电子TRASE公司R(右)A类电子MM(毫米)电致发光NDRFASYIEKVRF公司LE公司QQNKA公司L(左)AAELN公司QL公司R(右)韩国P(P)T型K(K)L(左)广告不良事件左后电致发光右心室右心室DQLTANS公司A类右心室电子V(V)电子研发 142
抄送:TIGR02168 711电子电子ELEQL公司R(右)K(K)电子LE公司电致发光SRQISALRKDLAR公司LE公司AEVEQ公司L(左)EERIA公司QL公司S公司-韩国L(左)T型电子L(左)----电子不良事件工业工程电致发光电气工程师右心室EEAEEEL公司A类每个电子A类电子工业工程 785
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吉4503979    143N个L(左)AQDLATVRQK公司L(左)QDETNLRL公司电子美国运通银行L(左)年平均值每个死地LER公司K(K)ESL公司电子EEIRF公司L(左)RKIH公司电子---电子EVRE公司L(左)QEQLARQQ公司 219
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吉4503979    220V(V)--------高压电气L(左)DVAKPD公司L(左)助教美国铝业公司KEI公司R(右)TQY公司电子调幅------AS公司S公司NMH公司电子AEEWYRSKFAD公司L(左)TDAAA公司R(右)NAE公司L(左)LRQAKH公司----- 280
抄送:TIGR02168 866电子谎言LEA公司L(左)LNERAS公司L(左)电气工程师美国铝业公司所有R(右)SEL公司电子电致发光LE公司S公司韩国标准电子LRRELEELREK公司L(左)AQLEL公司R(右)支腿L(左)埃夫里登勒克尔 945
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吉4503979    281--------------------EANDY公司相对应力L(左)质量体系L(左)TCDLES公司L(左)RGT公司N个ESLERQMR公司电子质量工程急诊室高压---重新评估每个LAR公司 333
抄送:TIGR02168 946seeysltleeaalenkied公司埃塞俄比亚相对应力R(右)L(左)韩国L(左)ENKIKE公司L(左)总现值N个LAAIEEYE公司电子斯里兰卡急诊室YD公司飞行训练AQKEDLT公司每个KET公司 1021
合同编号4913 合同编号4913
未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];
71-247 第3.08页至第05页

未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];


Pssm-ID:443941[多域]Cd长度:1089  比特分数:46.45  E值:第3.08页至第05页
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吉4503979  71埃及埃姆电致发光ND(无损检测)R(右)F类A类SYI公司电子千伏射频LE公司QQNK公司美国铝业公司AAELN公司L(左)R(右)AKEPTKLADVYQ公司美国运通重新L(左)RLR公司L(左)DQ值L(左)T型A类国家安全报告L(左)电动汽车电子R(右)D类N个L(左)------ 144
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抄送:COG4913 335纳克通用数据记录器L(左)均衡器电子R(右)电子风险回收率A类雷亚尔(RLEALLAALG)L(左)PLPASAEEFAA公司L(左)无线电高度表电子美国汽车协会L(左)LEAL公司电子工程师LEA公司L(左)电子电子A类洛杉矶------ 408
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吉4503979  223电子低密度病毒A类千帕分力TAA公司L(左)K(K)电子IRTQYEAMAS公司 247
抄送:COG4913 409电子航空航天局A类左后分力RRE公司L(左)R(右)电子出租人 433
合同编号4913 合同编号4913
未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];
118-334 3.82e-05日

未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];


Pssm-ID:443941[多域]Cd长度:1089  比特分数:46.06  E值:3.82e-05日
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吉4503979  118美国运通重新左后左后L(左)德奎特A类美国国家科学院埃弗登L(左)AQD公司L(左)自动电视R(右)QK公司L(左)QDETNLRLEA公司电子NN公司L(左)A类A类Y(Y)R(右)电子A类判定元件亚特兰大-RKI公司电子S公司LE公司电子电子 196
抄送:COG4913 272美国运通安永左后AA公司L(左)RLWF(RLWF)A类-----QRRLEL公司L(左)EAE公司L(左)EEL公司R(右)不良事件L(左)阿雷埃勒电子应收账L(左)D类A类L(左)R(右)电子电子L(左)判定元件LEAKIRGNG公司日间行车灯电子LE公司R(右)电子 346
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吉4503979  276RQ(请求)A类科恩D类Y(Y)相对应力L(左)质量体系L(左)TCDLE公司SL公司RG公司tneslerqmreqee公司R(右)HVREA公司A类SYQELARA公司L(左)电子电子电子 334
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PRK02224号 PRK02224号
DNA双链断裂修复;Rad50-ATPase;
117-344 5.63e-05年

DNA双链断裂修复;Rad50-ATPase;


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吉4503979   117质量保证电致发光重新L(左)RLRLDQ公司L(左)TANS公司A类右心室电子V(V)急诊室DN(公称直径)洛杉矶QDLA电视R(右)QK公司L(左)QDETNL公司R(右)LEANNLAAYRQE公司A类DEATLA公司R(右)劳埃德LE公司RKI公司电子S公司L(左)电子电气设备 196
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吉4503979   197红外荧光灯R(右)---KI公司H(H)电子电气工程师VRE公司L(左)电子QLAR公司-----QQVHV公司电子LDVAKPD公司L(左)助教A类LKEIRTQY公司电子AMAS公司MH公司电子不良事件电子R(右)SK公司F类A类D类LTDAA公司 268
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吉4503979   269阿奈尔L(左)RQAKH公司电子安迪R(右)RQLQS公司L(左)中药L(左)ESL公司R(右)全球技术网络电子SL公司电子RQMRE公司----------QEER公司高压重新评估电子报警LE公司电子电子GQS公司L(左) 338
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吉4503979   339杜兰特电子宗教硕士 344
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SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
116-371 2005年9月9日

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


Pssm-ID:274009[多域]Cd长度:1164  比特分数:45.06  E值:2005年9月9日
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吉4503979    116每年美国运通重新左后L(左)右心室DQ值L(左)TANSAR公司L(左)电动汽车电子RDNLAQD公司L(左)自动变速箱K(K)L(左)D类ETNLRL公司电子A类电子NNLAAYR公司质量工程阿迪特拉德LE公司RKIE公司SLE公司电子 195
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吉4503979    196工程安装rflrkih公司电子电子虚拟现实电致发光电子QL公司应收账qqvhveldva公司KPD公司L(左)TAA公司L(左)KEIRTQYEAMASSNM公司H(H)EAEEWYRSKFAD公司L(左)TDAAA公司R(右)NAEL公司L(左) 275
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吉4503979    276R(右)QAK公司热年RQ(请求)L(左)质量体系书信电报CDL公司电子S公司L(左)RGTNES公司L(左)急诊室MREQE公司电子重组人免疫缺陷病毒-----------------R(右)电子AASYQE公司美国铝业公司应收账LE公司EEGQS公司L(左) 338
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吉4503979    339K(K)D类电子马尔科伊QDL(左)LNVKLA公司L(左)模具ATY公司韩国L(左)L(左)电子 371
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MukB公司 COG3096号机组
染色体凝聚蛋白MukBEF、ATP酶和DNA-结合亚单位MukB[细胞周期控制,细胞。。。
63-374 2004年12月4日

染色体凝聚蛋白MukBEF、ATP酶和DNA-结合亚单位MukB【细胞周期控制、细胞分裂、染色体分割】;


Pssm-ID:442330[多域]Cd长度:1470  比特分数:44.56  E值:2004年12月4日
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吉4503979  63K(K)电子T型R(右)AS公司电子-RAE公司MM(毫米)电致发光国家发改委A类赛伊K(K)虚拟现实F类LE公司QNKA公司L(左)AAELN公司LRA公司TK公司洛杉矶DVYQ公司----美国运通重新左后L(左)R(右)LDQ公司L(左)TANS公司A类右心室 137
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吉4503979  138埃弗登L(左)A类D类L(左)ATVRQK公司LQ公司DET公司荷兰R(右)L(左)欧洲原子能机构荷兰A类A类yrqea公司判定元件ATLA公司右心室D类-L(左)埃尔基斯利电子EIR公司F类轻轨公司H(H)EEEVRE公司L(左)QEQL公司A类 216
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吉4503979  217RQ(请求)V(V)----高压电气L(左)DVAKPDLTAALKEIRT公司是的A类M(M)--------------------AS公司S公司NMH公司电子A类电子战Y(Y)R(右)SKFADLTD公司A类AARNA 272
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吉4503979  273电子L(左)LRQA公司科恩(KHEAND)Y(Y)RRQ公司L(左)SL公司T型信用违约互换电子S公司LRGTNES公司L(左)ERQMR公司电子电气工程师右侧V(V)REA公司A类syq(对称)每个洛杉矶R(右)LEEEGQS公司L(左)杜兰特电子马尔科伊QDL(左) 352
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吉4503979  353LNVKLALDI公司电子国际航空运输协会K(K)L(左)L(左)EGE公司电子 374
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氯丙酸 COG0542号机组
ATP-依赖性Clp蛋白酶,ATP-结合亚单位ClpA[翻译后修饰,蛋白质。。。
134-247 3.65e-04页

ATP-依赖性Clp蛋白酶,ATP-结合亚单位ClpA[翻译后修饰,蛋白质周转,伴侣];


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
164-394 5.37e-04页

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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COG2433公司 COG2433公司
核糖核酸酶H折叠,RuvC/YqgF家族的可能核酸酶【仅用于一般功能预测】;
97-226 6.59e-04号

核糖核酸酶H折叠,RuvC/YqgF家族的可能核酸酶【仅用于一般功能预测】;


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SMC_行程_A 钨极氩弧焊02169
染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(…的结构维护。。。
70-260 7月17日至04日

染色体分离蛋白SMC,主要为古菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。它存在于单个拷贝中,在原核生物中是同二聚体,但在真核生物中发现了六个副原核生物(不包括在这个家族中),其中SMC蛋白是异二聚体。该家族代表古生菌和一些细菌(水飞蓟、协同孢子虫等)的SMC蛋白;其他细菌的SMC用TIGR02168描述。该蛋白的N端和C端结构域非常保守,但中心铰链区域的组成偏斜且高度分化。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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合同编号4913 合同编号4913
未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];
118-339 1.55e-03号

未鉴定的保守蛋白,含有C末端ATP酶结构域[功能未知];


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CCDC158公司 pfam15921型
线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。。。
67-307 1.95e-03年

线圈结构域蛋白158;CCDC158是真核生物中发现的一个蛋白质家族。功能未知。


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齿轮1340 齿轮1340
未表征的线圈蛋白,包含DUF342结构域[功能未知];
64-241 2003年3月3日

未表征的线圈蛋白,包含DUF342结构域[功能未知];


Pssm-ID:440951[多域]Cd长度:297  比特分数:39.12  E值:2003年3月3日
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CusB_dom_1 pfam00529型
阳离子流出系统蛋白CusB结构域1;大肠杆菌阳离子流出系统蛋白CusB。。。
116-270 5.03e-03年5月

阳离子流出系统蛋白CusB结构域1;大肠杆菌阳离子流出系统蛋白CusB可分为四个不同的结构域,该蛋白的前三个结构域大多为β链,第四个结构域形成全α-螺旋结构域。该条目代表CusB的第一个β-结构域(结构域1),由多肽(残基89-102和324-385)的N和C末端形成。CusB是铜输送外排系统CusCFBA的一部分。该结构域也存在于其他膜融合蛋白中,如HlyD、MdtN、MdtE和AaeA。HlyD是典型的α-溶血素(HlyA)细菌I型分泌系统的一个成分,以及其他成分HlyB和TolC。HlyD通过单个跨膜结构域锚定在细胞质膜上,在羧基末端100个氨基酸中有一个大的周质结构域,HlyB和HlyD形成一个稳定的复合物,结合含有C末端HlyA信号序列的重组蛋白和细胞质中的ATP。HlyD、HlyB和TolC结合形成三组分ABC转运蛋白复合物,形成跨膜通道或孔,HlyA可通过该通道或孔直接转移到细胞外介质。已经证明,角质酶可以有效地通过这个孔进行运输。


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吉4503979    191-----ESL公司EEEIR公司(f)L(左)RKIHEEEVRELQE公司QL公司ARQQ公司V(V)高压电弧焊A类千帕分布式账本技术A类ALKEIRTQYEAMAS公司信噪比EAE公司EWYRSKFA公司分力T型 265
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吉4503979    266DAAA公司R(右) 270
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口香糖C COG3206号机组
胞外多糖输出蛋白/结构域GumC/Wzc1[细胞壁/膜/包膜生物发生];
111-371 2003年4月42日

胞外多糖输出蛋白/结构域GumC/Wzc1[细胞壁/膜/包膜生物发生];


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Smc公司 COG1196号文件
染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割]。。。
64-217 2003年7月37日

染色体分离ATP酶Smc[细胞周期控制,细胞分裂,染色体分割];


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PRK11637型 PRK11637型
AmiB活化剂;临时的
85-282 7.84e-03

AmiB活化剂;临时的


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SMC_行程_B 老虎02168
染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(…的结构维护。。。
162-377 9月58日-03日

染色体分离蛋白SMC,常见细菌型;SMC(染色体结构维持)蛋白结合DNA,组织和分离染色体以进行分割。SMC蛋白存在于细菌、古菌和真核生物中。该家族代表大多数细菌的SMC蛋白。SMC基因通常与scpB(TIGR00281)和scpA基因相关,其中scp代表分离和浓缩蛋白。SMC在S期早期被诱导,但在整个细胞周期中存在并与DNA结合。【细胞过程、细胞分裂、DNA代谢、染色体相关蛋白】


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抄送:TIGR02168 174R(右)K(K)电子T型电子韩国L(左)应急响应小组R(右)ENL公司D类雷迪尔内LER公司昆士兰州系统性红斑狼疮RQAEKAERYK公司电子1克A类电子L(左)REL公司ELA公司L(左)LVLRLE公司-电致发光REELEE公司L(左)质量工程LKE公司不良事件 252
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抄送:TIGR02168 328LESK公司低密度聚乙烯洛杉矶电子电子洛杉矶电子吉隆坡机场斯里兰卡电子电子莱斯利亚电子L(左)EAELEE公司L(左)爱思乐(ESRLEEEQ)LE公司TLRS千伏 388
 
爆破搜索参数
数据来源: 预计算数据,版本=cdd.v.3.21
预设选项:数据库:CDSEARCH/光盘低复杂性过滤器:没有基于成分的调整:是的E值阈值: 0.01

参考文献:

  • 王杰等(2023),“2023年的保守域数据库”,核酸研究51(D) 384-8中。
  • Lu S等人(2020),“2020年的保守域数据库”,核酸研究48(D) 265-8。
  • Marchler-Bauer A等人(2017年),“CDD/SPARCLE:通过亚家族结构域对蛋白质进行功能分类。”,核酸研究45(D) 2003年3月。
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