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数据字段

IMPC在其多个数据核心中使用一致的字段名。下表总结了与生物相关的领域。

字段名称描述
mp_term_id哺乳动物表型的标识符
mp_term_name(mp_term名称)哺乳动物表型的名称
顶层mp_term_id哺乳动物表型本体中顶级表型的标识符
顶层mp_term_name哺乳动物表型本体中顶级表型的名称
顶层mp_term_definition哺乳动物表型本体中顶级表型的定义
顶层mp_term同义词哺乳动物表型本体中顶级表型的替代名称
中间_ mp_终端_ id哺乳动物表型本体中直至顶级术语的所有表型的标识符
中间_ mp_术语_名称哺乳动物表型本体中直至顶级术语的所有表型的名称
中间_术语_定义哺乳动物表型本体论中所有表型的定义,最高可达一个顶级术语
中间词_术语_同义词哺乳动物表型本体中表型的替代名称,最高可达顶级术语
标记_符号小鼠基因符号
标记访问id小鼠基因标识符
上校_id菌落标识符
等位基因_名称基因型等位基因名称
等位基因符号Allele符号
等位基因接入id等位基因稳定标识符
应变接入id小鼠菌株标识符
遗传背景小鼠品系名称
表型中心进行表型分析的机构名称
项目_名称进行表型分析的研究项目的简称
项目全名进行表型分析的研究项目全称
资源_名称为其执行表型分析的资源的简称
资源id对其执行表型分析的资源的标识符
资源全名为其执行表型分析的资源的全名
突变样本的性别
合子性突变样本的合度
管道名称IMPRESS管道名称
管道表idIMPRESS管道标识符
管道_稳定_ keIMPRESS管道钥匙
程序_名称表型分析程序名称
程序表id表型鉴定程序标识符
程序稳定键表型鉴定程序的关键
统计方法统计程序名称
百分比更改连续数据影响大小的度量
p_value(p值)统计程序的P值
效果_大小效果大小
表型性指定表型的样本的性别
参数名称表型参数名称
参数表id表型参数标识符
参数表键表型参数键
控制选择方法用于选择一组对照动物进行统计测试的策略
从属变量统计测试中测试的变量
元数据收集数据的条件描述
元数据组收集在相同实验条件下进行测试的样本
男性_控制_计数对照组男性标本数量
雄性突变体计数实验组男性样本数
女性控制人数对照组女性标本数量
女性_突变_计数实验组女性样本数
地位来自统计分析的状态代码
其他信息有关计算的任何其他信息
原始输出(_O)计算期间R产生的字符串或输出
类别数据的类别
类别_值使用分类数据的统计检验的P值
类别效果大小分类数据的最大百分比变化
批次_重要批次是否重要的标志
差异_显著差异显著时的标志
空测试值统计检验的重要性
基因型影响值基因型效应的意义
基因型效应误差估计基因型效应标准误差的估计
基因型_效果_参数_估计基因型效应的效应大小估计
性别影响值性别效应的重要性
性别影响估计性别效应标准误差的估计
性别影响参数估计性别效应的效应大小估计
权重效果值重量的重要性
权重效果误差估计权重效应标准误差的估计
权重_效果_参数_估计权重效应的效应大小估计
第1组基因型第一组的基因型(通常为+/+)
第1组_残留_正常_测试第1组符合正态分布的显著性
2组基因型第二组的基因型(通常为菌落ID)
组2剩余_正常_测试第2组符合正态分布的显著性
蓝色_测试最佳线性无偏预测检验
旋转_残留_测试其他统计模型细节;参见PhenStat文档
拦截_估计其他统计模型细节;参见PhenStat文档
截取估计值其他统计模型细节;参见PhenStat文档
交互_重要性别*基因型交互作用显著性标志
交互效果_值性别*基因型交互作用的重要性
女性ko效应p值女性基因型的意义
女性ko效应tderr估计女性基因型的标准误差估计
女性ko参数估算女性基因型的影响大小
male_ko影响p值男性基因型的重要性
男_男_女_效果_错误_估计男性基因型的标准误差估计
male_ko参数估算男性基因型的影响大小
分类标签统计测试摘要
类omeroidOMERO图像系统中的标识符
下载url原始图像的URL(dicom、tiff或jpeg)
jpeg网址高分辨率图像文件的URL
基因访问id突变基因标识符
基因符号突变基因的符号
等位基因接入id突变等位基因标识符
等位基因符号等位基因中突变基因的符号
生物样本组指标(如果特定)是控制组或实验组的成员
元数据组标签
实验源id执行中心实验的标识符
观测类型实验类型,例如分类、一维、多维、时间序列、元数据
出生日期标本出生日期
实验日期收集数据的日期
重量试样重量
权重参数表id重量参数标识符
重量_日期观察重量的日期
重量_天_旧观察重量时的样本年龄(天)
数据点测量值
订单索引指示顺序
指示尺寸
time_point(时间点)指示测量数据的时间
离散点指示离散点
类别指示样本分类的类别
价值元数据的价值