IMPC在其多个数据核心中使用一致的字段名。下表总结了与生物相关的领域。
字段名称 | 描述 |
mp_term_id | 哺乳动物表型的标识符 |
mp_term_name(mp_term名称) | 哺乳动物表型的名称 |
顶层mp_term_id | 哺乳动物表型本体中顶级表型的标识符 |
顶层mp_term_name | 哺乳动物表型本体中顶级表型的名称 |
顶层mp_term_definition | 哺乳动物表型本体中顶级表型的定义 |
顶层mp_term同义词 | 哺乳动物表型本体中顶级表型的替代名称 |
中间_ mp_终端_ id | 哺乳动物表型本体中直至顶级术语的所有表型的标识符 |
中间_ mp_术语_名称 | 哺乳动物表型本体中直至顶级术语的所有表型的名称 |
中间_术语_定义 | 哺乳动物表型本体论中所有表型的定义,最高可达一个顶级术语 |
中间词_术语_同义词 | 哺乳动物表型本体中表型的替代名称,最高可达顶级术语 |
标记_符号 | 小鼠基因符号 |
标记访问id | 小鼠基因标识符 |
上校_id | 菌落标识符 |
等位基因_名称 | 基因型等位基因名称 |
等位基因符号 | Allele符号 |
等位基因接入id | 等位基因稳定标识符 |
应变接入id | 小鼠菌株标识符 |
遗传背景 | 小鼠品系名称 |
表型中心 | 进行表型分析的机构名称 |
项目_名称 | 进行表型分析的研究项目的简称 |
项目全名 | 进行表型分析的研究项目全称 |
资源_名称 | 为其执行表型分析的资源的简称 |
资源id | 对其执行表型分析的资源的标识符 |
资源全名 | 为其执行表型分析的资源的全名 |
性 | 突变样本的性别 |
合子性 | 突变样本的合度 |
管道名称 | IMPRESS管道名称 |
管道表id | IMPRESS管道标识符 |
管道_稳定_ ke | IMPRESS管道钥匙 |
程序_名称 | 表型分析程序名称 |
程序表id | 表型鉴定程序标识符 |
程序稳定键 | 表型鉴定程序的关键 |
统计方法 | 统计程序名称 |
百分比更改 | 连续数据影响大小的度量 |
p_value(p值) | 统计程序的P值 |
效果_大小 | 效果大小 |
表型性 | 指定表型的样本的性别 |
参数名称 | 表型参数名称 |
参数表id | 表型参数标识符 |
参数表键 | 表型参数键 |
控制选择方法 | 用于选择一组对照动物进行统计测试的策略 |
从属变量 | 统计测试中测试的变量 |
元数据 | 收集数据的条件描述 |
元数据组 | 收集在相同实验条件下进行测试的样本 |
男性_控制_计数 | 对照组男性标本数量 |
雄性突变体计数 | 实验组男性样本数 |
女性控制人数 | 对照组女性标本数量 |
女性_突变_计数 | 实验组女性样本数 |
地位 | 来自统计分析的状态代码 |
其他信息 | 有关计算的任何其他信息 |
原始输出(_O) | 计算期间R产生的字符串或输出 |
类别 | 数据的类别 |
类别_值 | 使用分类数据的统计检验的P值 |
类别效果大小 | 分类数据的最大百分比变化 |
批次_重要 | 批次是否重要的标志 |
差异_显著 | 差异显著时的标志 |
空测试值 | 统计检验的重要性 |
基因型影响值 | 基因型效应的意义 |
基因型效应误差估计 | 基因型效应标准误差的估计 |
基因型_效果_参数_估计 | 基因型效应的效应大小估计 |
性别影响值 | 性别效应的重要性 |
性别影响估计 | 性别效应标准误差的估计 |
性别影响参数估计 | 性别效应的效应大小估计 |
权重效果值 | 重量的重要性 |
权重效果误差估计 | 权重效应标准误差的估计 |
权重_效果_参数_估计 | 权重效应的效应大小估计 |
第1组基因型 | 第一组的基因型(通常为+/+) |
第1组_残留_正常_测试 | 第1组符合正态分布的显著性 |
2组基因型 | 第二组的基因型(通常为菌落ID) |
组2剩余_正常_测试 | 第2组符合正态分布的显著性 |
蓝色_测试 | 最佳线性无偏预测检验 |
旋转_残留_测试 | 其他统计模型细节;参见PhenStat文档 |
拦截_估计 | 其他统计模型细节;参见PhenStat文档 |
截取估计值 | 其他统计模型细节;参见PhenStat文档 |
交互_重要 | 性别*基因型交互作用显著性标志 |
交互效果_值 | 性别*基因型交互作用的重要性 |
女性ko效应p值 | 女性基因型的意义 |
女性ko效应tderr估计 | 女性基因型的标准误差估计 |
女性ko参数估算 | 女性基因型的影响大小 |
male_ko影响p值 | 男性基因型的重要性 |
男_男_女_效果_错误_估计 | 男性基因型的标准误差估计 |
male_ko参数估算 | 男性基因型的影响大小 |
分类标签 | 统计测试摘要 |
类omeroid | OMERO图像系统中的标识符 |
下载url | 原始图像的URL(dicom、tiff或jpeg) |
jpeg网址 | 高分辨率图像文件的URL |
基因访问id | 突变基因标识符 |
基因符号 | 突变基因的符号 |
等位基因接入id | 突变等位基因标识符 |
等位基因符号 | 等位基因中突变基因的符号 |
生物样本组 | 指标(如果特定)是控制组或实验组的成员 |
元数据组 | 标签 |
实验源id | 执行中心实验的标识符 |
观测类型 | 实验类型,例如分类、一维、多维、时间序列、元数据 |
出生日期 | 标本出生日期 |
实验日期 | 收集数据的日期 |
重量 | 试样重量 |
权重参数表id | 重量参数标识符 |
重量_日期 | 观察重量的日期 |
重量_天_旧 | 观察重量时的样本年龄(天) |
数据点 | 测量值 |
订单索引 | 指示顺序 |
维 | 指示尺寸 |
time_point(时间点) | 指示测量数据的时间 |
离散点 | 指示离散点 |
类别 | 指示样本分类的类别 |
价值 | 元数据的价值 |