小鼠基因组信息学：其他贡献的数据集和工具

这些数据集由作者贡献给MGI。目前，它们没有直接纳入关系型数据库。它们作为文本或Excel文件提供给查看或下载科学社区。我们鼓励这些专门的重要数据的贡献可能位于维护的结构化信息之外的集合作为社区合作的工具。有关数据提交准则，请参阅http://www.informatics.jax.org/submit.shtml或发送电子邮件至用户支持.

注："可查看文本“最好查看格式化的页面将浏览器设置为使用固定宽度的字体，如Courier。

目录
  1. ENU偶然突变数据文件
  2. 实验室小鼠的T31 RH映射面板和相关MGI标记
  3. 主要组织相容性复合体H2单倍型
  4. 近交系系谱图
  5. 129X1/SvJ与其他近交系微卫星标记的多态性
  6. RI应变分布模式（MGI）
  7. AXB和BXA的RI应变分布模式（Paigen）
  8. AXB和BXA的RI应变分布模式（Prows）
  9. 2-细胞胚胎基因列表
  10. MIT STS标记数据文件
  11. ES细胞原位杂交数据（M.S.Ko）
  12. FANTOM联盟基因本体注释
  13. 外显子测序数据用于识别Park7基因帕金森氏症表型的候选基因
  14. 10个自交系微卫星标记的多态性
  15. MGI策划的STS标记
  1. ENU偶然突变数据文件
    ENU突变中心提供的数据集列出了推测的突变通过对突变小鼠基因组进行测序发现。这些可能是存在于这些项目产生的库存中。文件可用作MS-Excel电子表格。

  2. 实验室小鼠的T31 RH映射面板和相关MGI标记
    参考文献：J： 68900，杰克逊实验室小鼠辐射杂交数据库，小鼠T31辐射杂交数据加载。

  3. 主要组织相容性复合体H2单倍型
    参考文献：杰克逊实验室遗传标准化小鼠手册附录F, MGI Staff提供的HTML版本。

  4. 近交系系谱图
    参考文献：J： 59229，Beck JA，Nat Genet 2000；24():23-25.

  5. 129X1/SvJ与其他近交系微卫星标记的多态性
    参考：J： 43843，Markel P；舒普；Ebeling C；佐治亚州卡尔森；纳格尔DL；Smutko股份公司；Moore KJ，理论和实证问题同源小鼠品系的标记辅助育种。，Nat Genet 1997年11月；17(3):280-4

  6. RI应变分布模式

  7. AXB和BXA的RI应变分布模式
    特别策划的数据集可作为MS-Excel电子表格，通过染色体。

    参考文献：J： 桑普森街45463号；希金斯DC；埃利奥特RW；Taylor BA；Lueders KK；科扎RA；Paigen B，AXB和BXA的编辑链接图重组近交系小鼠。，哺乳动物基因组1998年9月；9(9):688-694

  8. AXB和BXA的RI应变分布模式
    参考文献：Prows，D.R.和Horner，M.L.父母在AXB和BXA重组中的遗传贡献近交系小鼠。哺乳动物基因组13:127-133（2002）

  9. 2-细胞胚胎基因列表
    参考文献：Evsikov AV、de Vries WN、Peaston AE、Radford EE、Fancher KS、Chen FH、Blake JA、Bult CJ、Latham KE、Solter D、Knowles BB.2004。2细胞小鼠胚胎的系统生物学。细胞遗传学基因组研究105（2-4）：240-50。

  10. 带有发布数据的MIT STS标记数据文件
    参考文献：J： 34136，怀特黑德研究所/麻省理工学院，基因组研究中心，1999年数据库发布；()

  11. ES细胞原位杂交数据
    参考：J： 129777，卡特MG；阶段CA；Falco G；吉川T；Bassey加州大学；艾巴K；沙洛娃LV；Shaik N；Ko-MS，基于原位杂交的筛选小鼠ES细胞中的异质表达基因。，2008年基因表达模式8(3):181-98.

  12. FANTOM联盟基因本体论注释
    下面的文件包含由FANTOM联盟和RIKEN基因组探索研究小组，如以下出版物：

    Okazaki Y等人，2002年。基于功能注释的小鼠转录组分析60770条全长cDNA。自然。2002年12月5日；420(6915):563-73.

    Carninci P等人，2006年。哺乳动物基因组的转录图谱。科学。2005年9月2日；309(5740):1559-63.

    该文件为标准GO基因关联文件格式（参见：http://www.geneontology.org/GO.format.annotation.shtml详细信息）。

  13. 外显子测序数据用于识别Park7基因帕金森氏症表型的候选基因
    参考文献：J:186833，Rousseaux，MWC等人，帕金森病遗传模型中单侧到双侧进展的多巴胺能细胞进行性丢失，PNAS，2012年9月

  14. 10个自交系微卫星标记的多态性
    参考：Gurumurthy CB；Joshi PS；库尔茨S；大冢M；Quadros RM；危害DW；Lloyd K.用于标记辅助速度同源性筛选的常用小鼠菌株的简单序列长度多态性（SSLP）区域的验证。国际基因组学杂志. 2015.

  15. MGI策划的STS标记
    MGI策划了STS标记（STS）和基因组特征（GF）之间的关系[基因、假基因、其他基因组特征等]。