M-CSA是酶反应机制的数据库。它提供了对蛋白质、催化残基、辅因子和数百种酶的反应机制的注释。M-CSA中有两种条目详细的机构“条目更加完整，并以电子流箭头的形式显示了机构的各个化学步骤。”催化站点的条目注释了反应所需的催化残留物，但未显示其机理。

示例机制

生物种类： 嗜热水母（细菌）Uniprot公司
顺序： 第56868页 UniProt公司
PDB（PDB）： 1b73号 PDBe公司 PDB总和 1b73号
催化CATH域： 3.40.50.1860 CATHdb公司

谷氨酸消旋酶负责合成D-谷氨酸，这是肽聚糖的重要组成部分，存在于细菌细胞壁中，提供结构完整性。由于其对细菌的独特性，肽聚糖及其生物合成所涉及的酶是设计新抗菌药物的靶点。肽聚糖是由二糖、N-乙酰氨基葡萄糖和N-乙酰鼠尿酸的重复单元形成的，少量氨基酸（L-丙氨酸、D-丙氨酸、D-谷氨酸和赖氨酸或二氨基阿片酸）共价附着在该重复单元上。D-氨基酸的存在保护细胞壁免受只能识别L-异构体的蛋白酶的影响。

特征

最新统计数据

截至2024年9月22日，M-CSA包含1003种手工护理条目，其中734条包含详细信息机械描述。M-CSA中的条目代表895个EC编号。73211 SwissProt序列和15541 PDB是与这些条目同源，催化相同的反应并具有相同的活性位点，可能遵循相同的机制。

上次更新

2018年夏季-更多关于机制细节的参赛作品
由于Amelia Brasnett、Morwenna Hall、Charity Hornby和James Willey在夏季曾在Thornton集团担任实习生，具有详细机制描述的条目数量已从423条增加到684条。
新建网站
我们已将CSA（催化位点图谱）和MACiE（酶中的机制注释和分类）合并到同一数据库和网站中。新网站促进了数据输入过程，并支持不同的机制建议和其他改进。它由Python Django web框架和PostgreSQL数据库支持。

引用M-CSA

（见相关论文的完整列表）
  • 里贝罗AJM等。(2017),核酸研究,46，D618-D623。机制和催化位点图谱（M-CSA）：酶反应机制和活性位点数据库。内政部：10.1093/nar/gkx1012.PMID：29106569.