PDB总和条目7k2c

蛋白质结合

PDB id

7千2厘米

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			蛋白质链

					公元283年。


					公元11年。

			配体

					二氧化硫

			水域 ×111

PDB id：

7千2厘米

链接

姓名：

蛋白质结合

标题：

人keap1与nrf2肽结合的Kelch结构域

结构：

Kelch-like ech相关蛋白1。链：a，b。同义词：nrf2、inrf2、kelch-like蛋白19的细胞溶质抑制剂。工程设计：是的。Nrf2肽，阿德吉亚。链条：p.工程：是

资料来源：

智人。人类。有机体_出租车：9606。基因：keap1，inrf2，kiaa0132，klhl19。表达单位：大肠杆菌。表达式系统最大值：562。合成：是的。合成构造。有机体_出租车：32630

分辨率：

2.11Å

R系数：

0.238

无R：

0.271

作者：

S.N.Muellers，K.N.Allen公司

密钥参考：

P.C.Ortet公司等。(2021).在核磁共振、X射线晶体学和机器学习的指导下，总结了Nrf2对环七肽中KEAP1的结合亲和力。美国化学会志,143,3779-3793.PubMed编号：33683866 内政部：10.1021/jacs.0c09799

日期：

20年9月8日

发布日期：

21年4月7日

PROCHECK检查

	标题

	工具书类

蛋白质链

^？

问题14145 （keap_人类）-智人Kelch-like ECH-associated protein 1

序号：
结构：

序号：
结构：公元624年。
公元283年。*

蛋白质链

^？

问题16236 （NF2L2_HUMAN）-来自智人的核因子红系2相关因子2

序号：
结构：

序号：
结构：公元605年。
公元10年。*

密钥： PfamA域二级结构
* PDB和UniProt序列不同在6个残留位置（黑色十字架）



		酶反应

酶类：

链条A、B、P：电气控制。？

[国际酶] [ExPASy] [KEGG]（KEGG）【布伦达】

DOI编号：10.1021/jacs.0c09799 美国化学会志 143:3779-3793（2021年）

PubMed编号：33683866

在核磁共振、X射线晶体学和机器学习的指导下，总结了Nrf2对环七肽中KEAP1的结合亲和力。

P.C.Ortet公司， S.N.米勒， L.A.Viarengo-贝克， K.斯特鲁， B.R.Szymczyna公司， A.B.Beeler， K.N.艾伦， A.惠蒂。

摘要

大环化合物，包括大环肽，已显示出靶向性的前景具有挑战性的蛋白质相互作用（PPI）。一个引起高度关注的PPI是Kelch-like ECH-Associated Protein-1（KEAP1）与核因子之间（红细胞衍生2）样2（Nrf2）。在X射线晶体学、核磁共振、，建模和机器学习表明KEAP1的Nrf2可以在一个环状7肽中重述，c（c）[(D类)-β-homoAla-DPETGE]。该化合物是从Nrf2衍生线性肽GDEETGE(K（K）_D类=4.3μM）仅通过优化环状化合物的构象，而不改变任何KEAP1相互作用的残基。确定了每根线的X射线晶体结构和与KEAP1结合的环肽变体。尽管亲和力有很大的变化，肽结合残基的构象或观察到它们与KEAP1的相互作用。然而，分析机器学习的X射线结构表明结合配体可以通过亚星系畸变模式识别从未受约束的线性肽的几何结构观察。我们证明了这一点环肽亲和力的优化部分是通过构象与第78位脯氨酸替换相关的前组织非相互作用残基Asp77的几何形状，部分由应变减小引起ETGE图案本身。这种方法在剖析构象前组织和其他菌株之间的权衡配体受体系统。我们还鉴定了一对保守的疏水性核心DxETGE基序两侧的残基在促进Nrf2与KEAP1的高亲和力结合。