总管免疫系统09-FEB-11 3QO0IGG1 FAB片段的单倍体形式（与抗原复合标题2肽）与IGA共享相同的FV压缩机模具ID：1；化合物2分子：免疫球蛋白G1轻链的FAB片段；压缩机3链条：A；压缩机4 MOL_ID:2；化合物5分子：免疫球蛋白G1重链的FAB片段；压缩机6链条：B；压缩机7 MOL_ID:3；compnd8分子：来自微管蛋白β链的肽；压缩机9链条：C；compnd10同义词：微管蛋白β-5链；压缩机11工程：是源MOL_ID:1；来源2 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS；来源3有机物常见：人类；来源4 ORGANISM_TAXID:9606；来源5其他详细信息：血清；来源6 MOL_ID:2；资料来源7 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS；来源8有机物通用：人类；来源9 ORGANISM_TAXID:9606；来源10其他详细信息：血清；来源11 MOL_ID:3；来源12合成：是；资料来源13其他详细信息：标准肽合成。序列发生在资料来源：14种物种，如人类、小鼠、马、大鼠、两栖类等。KEYWDS免疫球蛋白折叠，免疫系统EXPDTA X射线衍射作者F.TRAJTENBERG，A.CORREA-BOVE，A.BUSCHIAZZO修订版2 2017年11月8日第3季度1备注修订日期：2012年2月15日第3季度JRNL授权F.TRAJTENBERG、A.CORREA-BOVE、O.PRITSCH、G.DIGHIERO、P.OPPEZZO，JRNL认证2 A.BUSCHIAZZO人IGA1和IGG1 FAB碎片的JRNL Title晶体结构JRNL TITL 2共享相同的可变域待发布的JRNL参考JRNL参考备注2备注2决议。2.30安氏硬度。备注3备注3精炼。备注3程序：BUSTER-TNT BUSTER 2.8.0备注3作者：BRICOGNE、BLANC、BRANDL、FLENSBURG、KELLER、，备注3:PACIOREK、ROVERSI、SHARFF、SMART、VONRHEIN、，备注3：沃马克、马修斯、滕·艾克、特伦鲁德备注3注释3细化中使用的数据。备注3分辨率范围高（安）：2.30备注3分辨率范围低（安）：28.23备注3数据截止（SIGMA（F））:0.000备注3范围（%）的完整性：99.9备注3反射次数：21224备注3备注3与精炼中使用的数据相匹配。备注3交叉验证方法：通关备注3自由R值测试集选择：随机备注3 R值（工作+测试集）：0.171备注3 R值（工作集）：0.169备注3自由R值：0.221备注3自由R值测试集大小（%）：4.760备注3自由R值测试集计数：1010备注3自由R值的估计误差：空备注3在最高分辨率的箱子中备注3。备注3使用的箱子总数：11备注3箱子分辨率范围高（角度）：2.30备注3箱子分辨率范围低（角度）：2.41备注3料仓完整性（工作+测试）（%）：空备注3箱子中的反射（工作+测试集）：2800备注3 BIN R值（工作+测试集）：0.2060备注3箱子中的反射（工作装置）：2663备注3 BIN R值（工作集）：0.2023备注3无箱R值：0.2802备注3无箱R值测试集大小（%）：4.89备注3无箱R值测试集计数：137备注3无箱R值的估计误差：空备注3备注3炼油中使用的非氢原子数量。备注3蛋白质原子：3309备注3核酸原子：0备注3异质原子：12备注3溶剂原子：227备注3记下3 B值。威尔逊图注释3（A**2）：40.76备注3平均B值（总体，A**2）：33.37备注3总体各向异性B值。备注3 B11（A**2）:3.97610备注3 B22（A**2）：-0.47970备注3 B33（A**2）：-3.49640备注3 B12（A**2）:0.00000备注3 B13（A**2）：-0.88790备注3 B23（A**2）：0.00000备注3备注3估计坐标误差。备注3 LUZZATI地块ESD（A）：0.255基于R值（A）的备注3 DPI（BLOW EQ-10）：空基于自由R值（A）的备注3 DPI（BLOW EQ-9）：空基于R值（A）的备注3 DPI（CRUICKSHANK）：空基于自由R值（A）的备注3 DPI（CRUICKSHANK）：空备注3备注3参考文献：BLOW，D.（2002）ACTA CRYST D58，792-797备注3 CRUICKSHANK，D.W.J.（1999）ACTA CRYST D55，583-601备注3备注3相关系数。备注3相关系数FO-FC:0.947备注3相关系数FO-FC FREE：0.908备注3备注3定义的几何函数项数量：15备注3术语配重功能。备注3保函长度：3388；2.000 ; 和声备注3结合角：4598；2.000 ; 和声备注3扭转角：1144；2.000 ; 正弦形备注3三角碳平面：74；2000年；和声备注3通用平面：495；5.000 ; 和声备注3各向同性热因子：3388；20.000 ; 和声备注3不良非绑定联系人：空；无效的；无效的备注3：扭力不当：空；无效的；无效的备注3伪旋转角度：空；无效的；无效的备注3手部不正确扭转：449；5.000 ; 半哈密顿语备注3占用总量：空；无效的；无效的备注3效用距离：空；无效的；无效的备注3公用设施角度：空；无效的；无效的备注3公用设施扭矩：空；无效的；无效的备注3理想清单合同条款：3890；4.000 ; 半哈密顿语备注3记下理想值的3个RMS偏差。备注3粘结长度（A）:0.010备注3粘结角（度）：1.28备注3肽欧米茄扭转角度（度）：3.64备注3其他扭转角（度）：20.34备注3备注3 TLS详细信息备注3 TLS组数量：4备注3备注3 TLS组：1备注3选择：{A|1-A|114}备注3组（A）的来源：26.7536-5.3230 12.7695备注3 T张力备注3 T11:-0.0553 T22:-0.0060备注3 T33:-0.0001 T12:0.0371备注3 T13:0.0044 T23:-0.0237备注3 L张力备注3 L11:1.5444 L22:0.2069备注3 L33:1.9264 L12:0.2928备注3 L13:0.1945 L23:-0.4523备注3张力备注3 S11:0.0569 S12:0.0377 S13:-0.0245备注3 S21:-0.0565 S22:-0.1247 S23:0.0236备注3 S31:0.1001 S32:0.1938 S33:0.0679备注3备注3 TLS组：2备注3选择：{A|115-A|219}备注3组（A）的来源：-0.0625-4.5187 39.5541备注3 T张力备注3 T11:-0.0374 T22:-0.0166备注3 T33:-0.0520 T12:-0.0196备注3 T13:0.0024 T23:0.0198备注3 L张力备注3 L11:2.1495 L22:1.5072备注3 L33:0.8664 L12:0.0619备注3 L13:-0.5783 L23:0.2591备注3张力备注3 S11:0.0191 S12:-0.0654 S13:-0.1134备注3 S21:0.1383 S22:-0.0351 S23:-0.0782备注3 S31:0.0321 S32:0.0279 S33:0.0160备注3备注3 TLS组：3备注3选择：｛B|1-B|119｝备注3组（A）的来源：9.0152 2.0859 0.5751备注3 T张力备注3 T11:-0.0777 T22:0.0140备注3 T33:-0.0061 T12:-0.0146备注3 T13:-0.0317 T23:0.0272备注3 L张力备注3 L11:1.4699 L22:1.1738备注3 L33:1.6916 L12:-0.3044备注3 L13:-0.8785 L23:-0.0782备注3张力备注3 S11:-0.0052 S12:0.2466 S13:0.2015备注3 S21:-0.1090 S22:-0.0045 S23:-0.0758备注3 S31:0.0552 S32:-0.0455 S33:0.0097备注3备注3 TLS组：4备注3选择：{B|120-B|220}备注3组来源（A）：-1.5371 8.0183 30.0162备注3 T张力备注3 T11:-0.0338 T22:-0.0604备注3 T33:-0.0205 T12:-0.0110备注3 T13:0.0113 T23:0.0278备注3 L张力备注3 L11:1.5531 L22:1.1503备注3 L33:1.9380 L12:0.2906备注3 L13:0.6603 L23:0.6347备注3张力备注3 S11:0.0183 S12:-0.1139 S13:-0.0219备注3 S21:0.0393 S22:-0.0500 S23:-0.0999备注3 S31:-0.1435 S32:-0.1023 S33:0.0316备注3备注3其他精炼备注：进行了TLS精炼备注4备注4 QO0符合格式V.3.30，2011年7月13日备注100备注100本条目已由PDBJ于2011年2月21日处理。备注100沉积ID为D_1000063885。备注200备注200实验细节备注200实验类型：X射线衍射备注200数据收集日期：2009年12月4日备注200温度（开尔文）：108备注200 PH:6.1备注200使用的晶体数量：1备注200备注200同步器（是/否）：N备注200辐射源：旋转阳极备注200光束线：空备注200 X射线发生器型号：RIGAKU MICROMAX-007 HF备注200单色或LAUE（M/L）：M备注200波长或范围（A）：1.5418备注200单色仪：VARIMAX-HF多层镜备注200光学器件：空备注200备注200探测器类型：图像板备注200探测器制造商：MAR扫描仪345 MM板备注200强度集成软件：XDS备注200数据缩放软件：SCALA 3.3.9备注200备注200独特反射次数：21241备注200分辨率范围高（A）：2.300备注200分辨率范围低（A）：28.232备注200拒绝标准（SIGMA（I））:0.000备注200总体评论200。备注200完整性范围（%）：99.9备注200数据冗余：3.700备注200合并（I）：空备注200 R SYM（I）:0.09700备注200对于数据集：12.4000备注200在最高分辨率外壳中备注200。备注200最高分辨率外壳，范围高（A）:2.30备注200最高分辨率外壳，射程低（A）：2.42备注200壳体完整性（%）：100.0REMARK 200 SHELL中的数据冗余度：3.60备注200 R壳体合并（I）:0.57200壳体（I）备注200 R SYM：0.57200备注200壳体：1.400备注200备注200衍射协议：单波长备注200用于确定结构的方法：福利尔合成备注200使用的软件：FFT备注200启动模型：空备注200备注200备注：空备注280备注280晶体备注280溶剂含量VS（%）：49.30备注280马修斯系数，VM（安氏**3/DA）：2.43备注280备注280结晶条件：0.1M NA柠檬酸盐，20%异丙醇，16%备注280 PEG 4000，PH6.1，蒸汽扩散，坐滴，温度293K备注290备注290晶体对称性注：空间群的290个对称算子：p1 21 1备注290备注290对称性备注290 NNNMMM操作员备注290 1555 X、Y、Z备注290 2555-X，Y+1/2，-Z备注290备注290，其中NNN->操作员编号备注290 MMM->翻译向量备注290备注290晶体对称变换备注290以下变换作用于原子/混合体在本条目中备注290条记录，以制作结晶备注290个相关分子。备注290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注290平方米2 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注290平方米1-10000000.000000 0.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 2 0.000000 1.000000 0.000000 33.63500备注290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000-1.000000 0.00000备注290备注290备注：空备注300备注300生物分子：1备注300有关作者提供的和/或程序，请参阅备注350备注300中生成的结构装配信息备注300此条目。备注还可能提供有关备注300埋地面积。备注350记下代表已知的完整乘数的350个坐标备注350生物意义上的齐聚状态备注350应用生物转化可以生成分子记住下面给出的350。非晶态和备注：给出了350个晶体分析操作。备注350备注350生物分子：1备注350作者确定的生物单位：三聚体备注350软件确定的四元结构：三元结构备注350使用的软件：PISA备注350总埋地面积：4460安**2备注复合体的350表面积：19360安**2备注350无溶剂能量变化：-22.0 KCAL/MOL备注350将以下内容应用于链条：A、B、C备注350生物1 1.0000000.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注350生物3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注465备注465缺失残留物备注465以下残留物不在备注465实验。（M=型号；RES=剩余名称；C=链条备注465标识符；SSSEQ=序列号；I=插入代码。）备注465备注465 M RES C SSSEQI备注465轮胎C-16备注465 GLN C-15备注465 GLN C-14备注465轮胎C-13备注465 GLN C-12备注465 ASP C-11备注465 ALA C-10注释465 THR C-9备注465 ALA C-8备注465 GLU C-7备注465 GLU C-6备注465 GLU C-5备注465 GLU C-4备注465 ASP C-3备注465 PHE C-2备注465 GLY C-1备注465 GLU C 0备注465 GLU C 3备注470备注470缺少原子备注470以下残留物缺少原子（M=型号；备注470 RES=剩余名称；C=链标识符；SSEQ=序列号；备注470 I=插入代码）：备注470 M RES CSSEQI ATOMS备注470 SER A 61 OG备注470 CYS A 219 SG备注470 GLU B 1 CG CD OE1 OE2备注470 SER B 25 OG备注470 ASN B 54 CG OD1 ND2备注470 ARG B 67 CG CD NE CZ NH1 NH2备注500注释500几何与立体化学备注500主题：扭转角备注500在预期的拉马钱德兰区域外标注500个扭转角：备注500（M=型号；RES=剩余名称；C=链标识符；备注500 SSEQ=序列号；I=插入代码）。备注500备注500标准表：备注500格式：（10X，I3,1X，A3,1X，A1，I4，A1,4X，F7.2,3X，F7.2）备注500备注500个预期值：GJ KLEYWEGT和TA JONES（1996）。PHI/PSI-记下500首合唱：拉马钱德朗重审。结构4，1395-1400备注500备注500 M RES CSSEQI PSI PHI备注500 LEU A 52-51.87-120.17备注500 SER A 57-4.18-144.32备注500 GLU A 218 5.37 51.66备注500 LYS B 43-169.18-107.75备注500 ARG B 67 95.87-55.49备注500 ALA B 94 166.83 177.92备注500 ARG B 107 18.97 59.79备注500 PRO B 219 170.36-58.39备注500备注500备注：空备注800备注800站点备注800站点标识符：AC1备注800证据_代码：软件备注800场地_描述：残体GOL A 220的结合场地备注800备注800站点标识符：AC2备注800证据_代码：软件备注800场地_描述：残积金A 221的结合场地备注900备注900个相关条目备注900相关ID:3M8O相关DB:PDB备注900相关ID:3QNX相关DB:PDB备注900相关ID:3QNY相关DB:PDB备注900相关ID:3QOZ相关DB:PDB备注900相关ID:3QO1相关DB:PDBDBREF 3QO0 A 1 219 PDB 3QO0QO0 1 219DBREF 3QO0 B 1 220 PDB 3QO 0 3QO 1 220DBREF 3QO0 C-16 3 UNP P07437 TBB5_HUMAN 422 441序列1 A 219 ASP ILE VAL MET THR GLN SER PRO LEU SER LEU SER VAL序列2 A 219 THR PRO GLY GLU PRO ALA SER ILE SER CYS ARG SER SER序列3 A 219 GLN SER LEU LEU ARG ARG ASP GLY HIS ASN ASP LEU GLU序列4 A 219 TRP轮胎LEU GLN LYS PRO GLY SER PRO GLN PRO LEU序列5 A 219 ILE TYR LEU GLY SER THR ARG ALA SER GLY VAL PRO ASP序列6 A 219 ARG PHE SER GLY SER GLYSER GLY-THR ASP PHE THR LEU序列7 A 219 LYS ILE ILE ARG VAL GLU ALA GLU ASP ALA GLY THR TYR序列8 A 219轮胎CYS MET GLN ASN LYS GLN THR PRO LEU THR PHE GLY序列9 A 219 GLN GLY THR ARG LEU GLU ILE LYS ARG THR VAL ALA ALA序列10 A 219 PRO SER VAL PHE ILE PHE PRO PRO SERASP GLU GLN LEU序列11 A 219 LYS SER GLY THR ALA SER VAL CYS LEU ASN ASN序列12 A 219 PHE TYR PRO ARG GLU ALA LYS VAL GLN TRP LYS VAL ASP序列13 A 219 ASN ALA LEU GLN SER GLY ASN SER GLN GLU SER VAL THR序列14 A 219 GLU GLN ASP SER LYS ASP SERT THR TYR SER LEU SER SER序列15 A 219 THR LEU THR LEU SER LYS ALA ASP TYR GLU LYS HIS LYS序列16一个219 VAL TYR ALA CYS GLU VAL THR HIS GLN GLY LEU SER序列序列17 A 219 PRO VAL THR LYS SER PHE ASN ARG GLY GLU CYS序列1 B 220 GLU VAL GLN LEU VAL GRU SER GLY GLY GLY LEU VAL-GLN序列2 B 220专业GLY GLY SER LEU LYS LEU SER CYS ALA ALA SER GLY序列3 B 220 PHE THR LEU SER GLY SER ASN VAL HIS TRP VAL ARG GLN序列4 B 220 ALA SER GLY LYS GLY LEU GLU TRP VAL GLY ARG ILE LYS序列5 B 220 ARG ASN ALA GLU SER ASP ALA THR ALA TYR ALA ALA SER序列6 B 220 MET ARG GLY ARG LEU THR ILE SER ARG ASP SER LYS序列7 B 220 ASN THR ALA PHE LEU GLN MET ASN SER LEU LYS SER ASP序列8 B 220 ASP THR ALA MET TYR CYS VAL ILE ARG GLY ASP VAL序列9 B 220轮胎ASN ARG GLN TRP GLY GLN GLY THR LEU VAL THR VAL序列10 B 220 SER SER ALA SER THR LYS GLY PRO SER VAL PHE PRO LEU序列11 B 220 ALA PRO SER SER LYS SER THR SER GLY GLY THR ALA ALA序列12 B 220 LEU GLY CYS LEU VAL LYS ASP TYR PHE PRO GLU PRO VAL序列13 B 220 THR VAL SER TRP ASN SER GLY ALA LEU THR SER GLY VALSEQRES 14 B 220他的THR PHE PRO ALA VAL LEU GLN SER GLY LEU TYR序列15 B 220 SER LEU SER SER VAL THR VAL PRO SER SER.LEU序列16 B 220 GLY THR GLN THR TYR ILE CYS ASN VAL ASN HIS LYS PRO序列17 B 220 SER ASN THR LYS VAL ASP LYS ARG VAL GLU PRO LYS序列1 C 20轮胎GLN GLN轮胎GLN ASP ALA THR ALA GLU GLU GLU序列2 C 20 ASP PHE GLY GLU GLU ALA GLUHET高尔夫A 220 6HET高尔夫A 221 6HETNAM GOL甘油HETSYN GOL甘油；丙烷-1,2,3-三醇配方4 GOL 2（C3 H8 O3）公式6 HOH*227（H2 O）螺旋1 1 GLU A 84 ALA A 88 5 5螺旋2 2 SER A 126 SER A 132 1 7螺旋3 3 LYS A 188 HIS A 194 1 7螺旋4 4 GLY A 217 CYS A 219 5 3螺旋5 5 THR B 28 SER B 32 5 5螺旋6 6 ARG B 53 SER B 57 5 5螺旋7 7 LYS B 89 THR B 93 5 5螺旋8 8 SER B 133 LYS B 135 5 3螺旋9 9 SER B 162 ALA B 164 5 3螺旋10 10 SER B 193 LEU B 195 5 3螺旋11 11 LYS B 207 ASN B 210 5 4表1 A 4 MET A 4 SER A 7 0表2 A 4 ALA 19 SER A 25-1 O SER A 22 N SER A 7表3 A 4 ASP A 75 ILE A 80-1 O PHE A 76 N CYS A 23表4 A 4 PHE A 67 SER A 72-1 N SER A 70 O THR A 77表1 B 6 SER A 10 VAL A 13 0表2 B 6 THR A 107 ILE A 111 1 O GLU A 110 N LEU A 11表3 B 6 GLY A 89 GLN A 95-1 N GLY A 89O LEU A 109表4 B 6 LEU A 38 GLN A 43-1 N GLU A 39 O MET A 94表5 B 6 GLN A 50轮胎A 54-1 O LEU A 52 N TRP A 40表6 B 6 THRA 58 ARG A 59-1 O THRA 58 N TYR A 54表1 C 4 SER A 10 VAL A 13 0表2 C 4 THR A 107 ILE A 111 1 O GLU A 110 N LEU A 11表3 C 4 GLY A 89 GLN A 95-1 N GLY A 89O LEU A 109表4 C 4 THR A 102 PHE A 103-1 O THR A 102N GLN A 95第1页第4页第119页第123页第0页表2 D 4 THR A 134 PHE A 144-1 O LEU A 140 N PHE A 121表3 D 4 TYR A 178 sera 187-1 O LEU A 180 N LEU A 141表4 D 4 SER A 164 VAL A 168-1 N GLN A 165 O THR A 183表1 E 4 ALA A 158 LEU A 159 0表2 E 4 LYS A 150 VAL A 155-1 N VAL A 255 O ALA 158表3 E 4 VAL A 196 THR A 202-1 O GLU A 200 N GLN A 152表4 E 4 VAL A 210 ASN A 215-1 O VAL A 210N VAL A 201表1 F 4 GLN B 3 SER B 7 0表2 F 4 LEU B 18 SER B 25-1 O ALA B 23 N VAL B 5表3 F 4 THR B 80 MET B 85-1 O MET B 85N LEU B 18表4 F 4 LEU B 70 ASP B 75-1 N ASP B 75O THR B 80表1 G 6 GLY B 10 VAL B 12 0表2 G 6 THR B 113 VAL B 117 1 O LEU B 114 N GLY B 10表3 G 6 ALA B 94 ARG B 101-1 N ALA B 94O VAL B 115表4 G 6 ASN B 33 GLN B 39-1 N VAL B 37 O TYR B 97表5 G 6 GLU B 46 ILE B 51-1 O VAL B 48 N TRP B 36表6 G 6 THR B 60 TYR B 62-1 O ALA B 61 N ARG B 50表1 H 4 GLY B 10 VAL B 12 0表2 H 4 THR B 113 VAL B 117 1 O LEU B 114 N GLY B 10表3 H 4 ALA B 94 ARG B 101-1 N ALA 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