标题转录19年10月23日6T7V标题KEAP1与肽8的复合物压缩机模具ID：1；化合物2分子：类KELCH ECH相关蛋白1；压缩机3链条：A；化合物4碎片：KELCH域，残渣321-609；化合物5异名：NRF2、INRF2、KELCH样蛋白19的细胞溶质抑制剂；压缩机6工程：是；压缩机7 MOL_ID:2；COMPND 8分子：LEU-ASP-PRO-GLU-THR-GLY-GLU-PHE-LEU；压缩机9链条：I；压缩机10工程：是源MOL_ID:1；来源2 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS；来源3有机物常见：人类；来源4 ORGANISM_TAXID:9606；来源5基因：KEAP1，INRF2，KIAA0132，KLHL19；来源6表达_系统：大肠杆菌；来源7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID:562；来源8 MOL_ID:2；来源9合成：是；资料来源：10 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS；来源11 ORGANISM_TAXID:9606KEYWDS KEAP1、泛素化、INRF2、KIAA0132、KLHL19、PROTEROSKEYWDS 2 BIOSTRUCTURES GMBH，转录EXPDTA X射线衍射作者S.COLARUSSO修订版2 28-OCT-20 6T7V 1 JRNL修订版1 09-SEP-20 6T7V 0JRNL AUTH S.COLARUSSO、D.DE SIMONE、T.FRATTARELLI、M.ANDREINI、，JRNL AUTH 2 M.CERRETANI、A.MISSINEO、D.MORETTI、S.TAMBONE、G.KEMPF、，JRNL授权3 M.AUGUSTIN，S.STEINBACHER，I.MUNOZ-SANJUAN，L.PARK，V.SUMMA，JRNL授权4 L.TOMEI、A.BRESCIANI、C.DOMINGUEZ、L.TOLEDO-SHERMAN、E.BIANCHI线性和环状肽抑制剂的JRNL优化JRNL TITL 2 KEAP1-NRF2蛋白质-蛋白质相互作用。JRNL参考BIOORG。医学化学。V.28 15738 2020年JRNL参考ESSN 1464-3391JRNL PMID 33065433号JRNL DOI 10.1016/J.BMC.2020.115738备注2备注2决议。2.60角度。备注3备注3精炼。备注3程序：REFMAC 5.6.0117备注3作者：穆舒多夫、斯库巴克、勒贝德夫、潘努、斯坦纳，备注3:NICHOLLS、WINN、LONG、VAGIN备注3备注3精炼目标：空备注3备注3精炼中使用的数据。备注3分辨率范围高（安）：2.60备注3分辨率范围低（安）：65.32备注3数据截止（SIGMA（F））:0.000备注3范围完整性（%）：94.4备注3反射次数：10584备注3备注3与精炼中使用的数据相匹配。备注3交叉验证方法：贯穿始终备注3自由R值测试集选择：随机备注3 R值（工作+测试集）：0.207备注3 R值（工作集）：0.202备注3自由R值：0.275备注3自由R值测试集大小（%）：6.900备注3自由R值测试集计数：786备注3在最高分辨率的箱子中备注3。备注3使用的箱子总数：空备注3箱子分辨率范围高（A）：2.60备注3箱子分辨率范围低（A）：2.67备注3箱子中的反射（工作装置）：700备注3箱子完整性（工作+测试）（%）：94.99备注3 BIN R值（工作集）：0.3310备注3无箱R值设置计数：59备注3无箱R值：0.4500备注3备注3炼油中使用的非氢原子数量。备注3蛋白质原子：2257备注3核酸原子：0备注3异质原子：4备注3溶剂原子：73备注3备注3 B值。威尔逊地块备注3（A**2）：空备注3平均B值（总体，A**2）：46.89备注3总体各向异性B值。备注3 B11（A**2）：-2.1700备注3 B22（A**2）：-2.1700备注3 B33（A**2）：3.25000备注3 B12（A**2）：-1.08000备注3 B13（A**2）:0.00000备注3 B23（A**2）：0.00000备注3备注3估计的总体坐标误差。备注3基于R值的ESU（A）:0.749备注3基于自由R值（A）的ESU：0.351备注3基于最大似然（A）的ESU：0.284备注3基于最大似然的B值ESU（A**2）：13.948备注3备注3相关系数。备注3相关系数FO-FC:0.937备注3相关系数FO-FC FREE：0.906备注3备注3 RMS与理想值的偏差计算RMS权重备注3键长精炼原子（A）:2314；0.007 ; 0.019备注3粘结长度其他（A）:1527；0.002 ; 0.020备注3键角精细原子（度）:3150；1.133 ; 1.939备注3粘合角其他（度）：3674；0.961 ; 3备注3扭转角，周期1（度）：292；6.710 ; 5备注3扭转角，周期2（度）：110；32.655 ;22.636备注3扭转角，周期3（度）：338；11.390 ;15备注3扭转角，周期4（度）：22；14.312 ;15备注3手心约束（A**3）：337；0.073 ; 0.200备注3精炼原子总平面图（A）：2664；0.004 ; 0.021备注3总平面其他（A）:514；0.001 ; 0.020备注3非结合接触精炼原子（A）：空；无效的；无效的备注3非粘结触点其他（A）：空；无效的；无效的备注3非键合扭转精炼原子（A）：空；无效的；无效的备注3非粘结扭转其他（A）：空；无效的；无效的备注3氢键（X…Y）精炼原子（A）：空；无效的；无效的备注3氢键（X…Y）其他（A）：空；无效的；无效的备注3潜在金属离子精炼原子（A）：空；无效的；无效的备注3潜在金属离子其他（A）：空；无效的；无效的备注3对称VDW精炼原子（A）：空；无效的；无效的备注3对称VDW其他（A）：空；无效的；无效的备注3对称氢键精炼原子（A）：空；无效的；无效的备注3对称氢键其他（A）：空；无效的；无效的备注3对称金属离子精炼原子（A）：空；无效的；无效的备注3对称金属离子其他（A）：空；无效的；无效的备注3备注3各向异性热因子限制。计数均方根重量备注3主链键精炼原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3主链键其他原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3主链角精炼原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3其他原子的主链角（A**2）：空；无效的；无效的备注3侧链键精炼原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3侧链键其他原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3精炼原子侧链角（A**2）：空；无效的；无效的备注3其他原子的侧链角（A**2）：空；无效的；无效的备注3长程B精炼原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3远程B其他原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3备注3各向异性热因子约束。计算RMS重量备注3刚性约束（A**2）：空；无效的；无效的备注3球性；自由原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3球性；结合原子（A**2）：空；无效的；无效的备注3备注3 NCS约束统计备注3不同NCS组的数量：空备注3备注3 TLS详细信息备注3 TLS组数：空备注3备注3散装溶剂建模。备注3使用的方法：空备注3遮罩计算参数备注3 VDW探头半径：1.20备注3离子探针半径：0.80备注3收缩半径：0.80备注3备注3其他炼油备注：骑行中添加了氢气备注3个位置U值：单独细化备注4备注4 6T7V符合格式V.3.30，2011年7月13日备注100备注100本条目已由PDBE于19年10月23日处理。备注100存款ID为D_1292104840。备注200备注200实验细节备注200实验类型：X射线衍射备注200数据收集日期：2014年12月5日备注200温度（开尔文）：100.000备注200 PH:NULL备注200使用的晶体数量：1备注200备注200同步器（是/否）：是备注200辐射源：SLS备注200梁线：X06SA备注200 X射线发生器型号：空备注200单色或LAUE（M/L）：M备注200波长或范围（A）：1.00000备注200单色仪：空备注200光学器件：空备注200备注200探测器类型：像素备注200探测器制造商：DECTRIS PILATUS 6M备注200强度集成软件：XDS备注200数据缩放软件：XSCALE备注200备注200独特反射次数：11370备注200分辨率范围高（A）：2.600备注200分辨率范围低（A）：65.320备注200拒绝标准（SIGMA（I））：空备注200总体评论200。备注200范围的完整性（%）：94.3备注200数据冗余：6.200备注200合并（I）:0.08400备注200 R SYM（I）：空备注200对于数据集：17.7700备注200在最高分辨率外壳中备注200。备注200最高分辨率外壳，范围高（A）：2.60备注200最高分辨率外壳，范围低（A）：2.81备注200壳体完整性（%）：95.7在外壳中备注200数据冗余：6.10备注200 R壳体合并（I）：0.45100外壳（I）的备注200 R符号：空备注200对于SHELL：NULL备注200备注200衍射协议：单波长备注200用于确定结构的方法：分子替换备注200使用的软件：MOLREP备注200启动模型：空备注200备注200备注：空备注280备注280晶体备注280溶剂含量VS（%）：58.08备注280马修斯系数，VM（角度**3/DA）：2.93备注280备注280结晶条件：醋酸铵、蒸汽扩散、，备注280悬滴，温度277K备注290备注290晶体对称性备注290空间群的对称算子：P 32 2 1备注290备注290对称性备注290 NNNMMM操作员备注290 1555 X、Y、Z备注290 2555-Y、X-Y、Z+2/3备注290 3555-X+Y、-X、Z+1/3备注290 4555 Y、X、-Z备注290 5555 X-Y，-Y，-Z+1/3备注290 6555-X，-X+Y，-Z+2/3备注290备注290，其中NNN->操作员编号备注290 MMM->翻译向量备注290备注290晶体对称变换备注290以下变换作用于原子/混合体在本条目中备注290条记录，以制作结晶备注290个相关分子。备注290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注290 SMTRY1 2-0.500000-0.866025 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 2 0.866025-0.500000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 1.000000 76.33133备注290 SMTRY1 3-0.500000 0.866025 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 3-0.866025-0.500000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000 1.000000 38.16567备注290 SMTRY1 4-0.500000 0.866025 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 4 0.866025 0.500000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000-1.000000 0.00000备注290 SMTRY1 5 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注290 SMTRY2 5 0.000000-1.000000.000000 0.00000备注290 SMTRY3 5 0.000000 0.000000-1.000000 38.16567备注290 SMTRY1 6-0.500000-0.866025 0.000000 0.00000备注290 SMTRY2 6-0.866025 0.500000 0.000000 0.00000备注290 SMTRY3 6 0.000000 0.000000-1.000000 76.33133备注290REMARK 290备注：空备注300备注300生物分子：1备注300有关作者提供的和/或程序，请参阅备注350备注300中生成的结构装配信息备注300此条目。备注还可能提供有关备注300埋地面积。备注350记下代表已知的完整乘数的350个坐标备注350生物意义上的齐聚状态备注350应用生物转化可以生成分子记住下面给出的350。非晶态和备注：给出了350个晶体分析操作。备注350备注350生物分子：1备注350作者确定的生物单位：DIMERIC备注350软件确定的四元结构：DIMERIC备注350使用的软件：PISA备注350总埋地面积：1250安**2备注350复合体的表面积：12070埃**2备注350无溶剂能量变化：0.0 KCAL/MOL备注350对链条应用以下内容：A、I备注350生物1 1.0000000.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注465备注465缺失残留物备注465以下残留物不在备注465实验。（M=型号；RES=剩余名称；C=链条备注465标识符；SSSEQ=序列号；I=插入代码。）备注465备注465 M RES C SSSEQI备注465 GLY A 317备注465 SER A 318备注465 HIS A 319备注465 MET A 320备注465 ALA A 321备注465 PRO A 322备注465 LYS A 323备注465 VAL A 324备注500评论500几何学和立体化学备注500副标题：扭转角备注500在预期的拉马钱德兰区域外标注500个扭转角：备注500（M=型号；RES=剩余名称；C=链标识符；备注500 SSEQ=序列号；I=插入代码）。备注500备注500标准表：备注500格式：（10X，I3,1X，A3,1X，A1，I4，A1,4X，F7.2,3X，F7.2）备注500备注500个预期值：GJ KLEYWEGT和TA JONES（1996）。PHI/PSI-记下500首合唱：拉马钱德朗重温。结构4，1395-1400备注500备注500 M RES CSSEQI PSI PHI备注500 ARG A 336-47.06 66.66备注500备注500备注：空备注800备注800站点备注800站点标识符：AC1备注800证据_代码：软件备注800位点_描述：残基ACT A 701的结合位点DBREF 6T7V A 321 609 UNP Q14145 KEAP1_HUMAN 321 608号DBREF 6T7V I 76 84 PDB 6T7V6 T7V 76 84数据库SEQADV 6T7V GLY A 317 UNP Q14145表达标签SEQADV 6T7V SER A 318 UNP Q14145表达标签SEQADV 6T7V HIS A 319 UNP Q14145表达标签SEQADV 6T7V MET A 320 UNP Q14145表达标签SEQADV 6T7V ALA A 540 UNP Q14145 GLU 540冲突SEQADV 6T7V ALA A 542 UNP Q14145 GLU 542冲突序列1 293 GLY SER HIS MET ALA PRO LYS VAL GLY ARG LEU ILE TYR序列2 A 293 THR ALA GLY GLY TYR PHE ARG GLN SER LEU SER TYR LEU序列3 A 293 GLU ALA TYR ASN PRO SER ASP GLY THR TRP LEU ARG LEU序列4 A 293 ALA ASP LEU GLN VAL PRO ARG SER GLY LEU ALA GLY CYS序列5 A 293 VAL VAL GLY GLY LEU TYR ALA VAL GLY GLY ARG ASN序列6 A 293 ASN SER PRO ASP GLY ASN THR ASP SER ALA LEU ASP序列7 A 293 CYS TYR ASN PRO MET THR ASN GLN TRP SER PRO CYS ALA序列8 A 293 PRO MET SER VAL PRO ARG ASN ARG ILE GLY VAL GLY VAL序列9 A 293 ILE ASP GLY HIS ILE TYR ALA VAL GLY GLY SER HIS GLY序列10 A 293 CYS ILE HIS ASN SER VAL GLU ARG TYR GLU PRO GLU序列11 A 293 ARG ASP GLU TRP HIS LEU VAL ALA PRO MET LEU THR ARG序列12 A 293 ARG ILE GLY VAL GLY VAL-ALA VAL LEU ASN ARG LEU LEU序列13 A 293轮胎ALA VAL GLY GLY PHE ASP GLY THR ASN ARG LEU ASN序列14 A 293 SER ALA GLU CYS TYR PRO GLU ARG ASN GLU TRP ARGSEQRES 15 A 293遇到了ILE THR ALA遇到了as n THR ILE ARG SER GLY ALA GLY序列16 A 293 VAL CYS VAL LEU HIS ASN CYS ILE TYR ALA ALA GLY GLY序列17 A 293轮胎ASP GLY GLN ASP GLN LEU ASN SER VAL GLU ARG轮胎序列18 A 293 ASP VAL ALA THR ALA THR-TRP THR PHE VAL ALA-PRO MET序列19 A 293 LYS HIS ARG ARG SER ALA LEU GLY ILE THR VAL HIS GLN序列20 A 293 GLY ARG ILE TYR VAL LEU GLY GLY TYR ASP GLY HIS THR序列21 A 293 PHE LEU ASP SER VAL GLU CYS TYR ASP PRO ASP THR ASP序列22 A 293 THR TRP SER GLU VAL THR ARG MET THR SER GLY ARG SER序列23 A 293 GLY VAL GLY VAL ALA VAL THRSEQRES 1 I 9 LEU ASP-PRO-GLU THR-GLY-GLU-PHE-LEU序列HET法案A 701 4HETNAM ACT醋酸盐离子配方3 ACT C2 H3 O2 1-配方4 HOH*73（H2 O）表1 AA1 4 THR A 351 ARG A 354 0表2 AA1 4 LEU A 342 ASN A 346-1 N ALA A 344 O LEU A 353表3 AA1 4 ILE A 328 ALA A 331-1 N THR A 330 O GLU A 343表4 AA1 4 GLY A 605 VAL A 608-1 O GLY A 60 5 N ALA 331表1 AA2 4 ALA A 366 VAL A 370 0表2 AA2 4 LEU A 373 VAL A 377-1 O TYR A 375 N CYS A 368表3 AA2 4 LEU A 393 ASN A 397-1 O TYR A 396 N LEU A 374表4 AA2 4 GLN A 402 PRO A 405-1 O SER A 404 N CYS A 395表1 AA3 2 ARG A 380 ASN A 382 0表2 AA3 2 ASN A 387 ASP A 389-1 O THR A 388 N ASN A 38表1 AA4 GLY A 417 ILE A 421 0表2 AA4 4 HIS A 424 VAL A 428-1 O VAL A 128 N GLY A 417表3 AA4 4 VAL A 440 GLU A 444-1 O GLU A 44 1 N ALA 427表4 AA4 4 GLU A 449 LEU A 452-1 O HIS A 451 N ARG A 442表1 AA5 2 SER A 431 HIS A 432 0表2 AA5 2 ILE A 435 HIS A 436-1 O ILE A 43 5 N HIS A 43 2表1 AA6 4 GLY A 464 LEU A 468 0表2 AA6 4 LEU A 471 PHE A 478-1 O LEU A 47 1 N LEU A 468表3 AA6 4 ARG A 483 TYR A 491-1 O LEU A 484 N GLY A 477表4 AA6 4 GLU A 496 ILE A 500-1 O ARG A 498 N CYS A 489表1 AA7 4 GLY A 511 LEU A 515 0表2 AA7 4 CYS A 518 ALA A 522-1 O ALA 522 N GLY A 511表3 AA7 4 VAL A 534 ASP A 538-1 O TYR A 537 N ILE A 519表4 AA7 4穿过A 543 VAL A 547-1 O穿过A 545 N ARG A 536表1 AA8 4 GLY A 558 VAL A 561 0表2 AA8 4 ILE A 566 TYR A 572-1 O TYR B 567 N THR A 560表3 AA8 4 PHE A 577 ASP A 585-1 O TYR A 584 N ILE A 566表4 AA8 4 THR A 590 ARG A 596-1 O SER A 592 N CYS A 583SSBOND 1 CYS A 434 CYS A434 1555 5555 2.91担保场地1 AC1 5 LEU A 471 TYR A 491 PRO A 492 GLU A 493站点2 AC1 5 ARG A 494晶体1 75.430 75.430 114.497 90.00 90.00 120.00 P 32 2 1 6原始X1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000ORIGX2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 0.00000ORIGX3 0.000000 0.000000 1.0000000.00000比例尺1 0.013257 0.007654 0.000000 0.00000比例尺2 0.000000 0.015308 0.000000 0.00000比例尺3 0.000000 0.000000 0.008734 0.00000