加拿大研究主席计划符合联邦研究资助组织的利益冲突和保密政策确保有效管理评审过程中任何参与者的利益冲突，并确保在评审过程中对提交给项目的个人信息和机密商业信息保密。
利益冲突是指一个人在审查过程中的职责和责任与该人的私人、专业、商业或公共利益之间的冲突。当评审委员会成员、外部评审员、裁判或观察员：
- 将从被审查的提名中获得专业或个人利益；
- 与被提名人或被提名人的机构有专业或个人关系；或
- 在被审查的提名中有直接或间接的经济利益。
当委员会成员、外部评审员、裁判或观察员：
- 是被提名人的亲属或密友，或与被提名人有私人关系；
- 能够从提名资金中获得或损失财务/物质利益；
- 与提名人长期存在科学或个人分歧；
- 目前隶属于被提名人的机构、组织或公司，包括研究医院和研究机构；
- 由于在过去六年中：
- 在其部门、机构、组织或公司的职责过程中，与被提名人经常进行互动；
- 被提名人的主管或受训人员；
- 与提名人合作、公布或共享资金，或计划在近期内这样做；或者，
- 被提名机构聘用；和/或
- 觉得由于任何原因都无法对提名进行公正的审查。
加拿大研究主席计划保留解决不确定性领域和确定是否存在冲突的权利。