摘要
基因组测序已广泛用于研究SARS-CoV-2的进化,已将90000多个基因组序列上传至GISAID数据库。我们公布了SARS-CoV-2基因组测序方法(https://www.protocols.io/view/ncov-2019-sequeencing-protocol-bbmuik6w)2020年1月22日在线。由于其简单性和成本效益,这种方法迅速成为SARS-CoV-2测序的最流行方法。在这里,我们提出了对原始方案的改进:i)用22个额外引物更新引物方案,以提高基因组覆盖率,ii)简化的文库准备工作流程,可提高多达96个样本的解复用率,并将实际操作时间减少数小时;iii)节约成本,将试剂成本降至每个样本10英镑,使单个实验室能够对数千个SARS-CoV-2基因组进行测序,以支持国家和国际基因组流行病学研究。
竞争性利益声明
J.R.T.、J.Q.和N.J.L.都收到了牛津纳米孔技术公司的差旅费和住宿费,以便在组织的活动中发言。P.J.和D.S.是牛津纳米孔技术公司的员工。