健康控制状态检查器

从GEO下载基因表达数据集并检查其是否包含健康对照数据


生物导体版本:释放(3.19)

一个函数,它读取基因表达数据集的GEO加入码,从GEO检索其数据,并检查数据集中是否存在健康对照的数据。如果找到健康控件数据,则返回true,否则返回false。GEO:基因表达综合。ID:标识符代码。GEO数据集从URL下载.

作者:大卫·奇科[aut,cre]

维护人员:大卫·奇科(Davide Chicco)<Davide.Chicco at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“healthyControlsPresenceChecker”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“healthyControlsPresenceChecker”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“健康控制状态检查器”)
healthyControlsPresenceChecker小品 HTML格式 R脚本
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新闻 文本

细节

生物视图 实验数据,表达式数据,地理位置,存储库数据
版本 1.8.0
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.0.0)
进口 xml语言2,地理查询,GEO的基因表达,马格里特
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/davidechicco/healthyControlsPresenceChecker
Bug报告 https://github.com/davidechicco/healthyControlsPresenceChecker/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 健康控制状态检查器_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/healthyControlsPresenceChecker
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/healthyControlsPresenceChecker
包短Url https://bioconductor.org/packages/healthyControlsPresenceChecker/
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