多萝西娅

人类和小鼠TF调节因子集合


生物导体版本:释放(3.19)

DoRothEA是一个包含标记转录因子(TF)-靶基因相互作用的基因调控网络。DoRothEA调节子是TF及其转录靶点的集合,从人类和小鼠的不同类型证据中收集整理。根据支持证据的数量为每个TF-目标交互分配一个置信水平。

作者:Pau Badia-i-Mompel[创建],丹尼尔·迪米特洛夫[aut],克里斯蒂安·霍兰德[aut]、卢斯·加西亚-阿隆索[aut]、阿尔贝托·瓦尔迪奥利维斯[ctb]、米努·阿什蒂亚尼[ctb'、阿提拉·加博[ctb]

维护人员:Pau Badia-i-Mompel<Pau.adia at uni heidelberg.de>巴迪亚大学

引文(从R中输入引文(“多萝西娅”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“dorothea”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“dorothea”)
DoRothEA调节器。 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 实验数据,人乳头数据,Mus_肌肉_数据
版本 1.16.0
许可证 GPL-3+文件许可证
取决于 R(>=4.0)
进口 数字播放器,马格里特,bcellViper公司,解耦器R
系统要求
统一资源定位地址 https://saezlab.github.io/dorothea网站/ https://github.com/saezlab/dorothea网站
Bug报告 https://github.com/saezlab/dorothea/issues
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程序包档案

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源程序包 多萝西娅_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dorothea网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/dorothea
包短Url https://bioconductor.org/packages/dorothea网站/
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