管理PCaData
治愈前列腺癌数据
生物导体版本:释放(3.19)
PCaData包提供了一系列注释前列腺癌数据集,这些数据集具有多个组学、手动管理的元数据和衍生的下游变量。这些研究通过ExperimentHub作为多分析实验(MAE)对象提供,包括与基因表达、拷贝数改变和体细胞突变数据相关的临床特征。此外,还提供了根据这些多组分数据计算的下游特征。多个小插曲有助于掌握各种研究的特点,并为利用此处提供的多个研究提供示例探索性和元分析。
作者:蒂穆·丹尼尔·拉贾拉[aut,cre]
、乔丹·克里德(Jordan Creed)、克里斯特尔·科林·莱辛格(Christelle Colin Leitzinger)、瓦尔莎·斯雷坎思(Varsha Sreekanth)、费德里科·卡尔博利(Federico Calboli)、卡拉玛西·辛加拉韦卢(Kalaimathy Singaravelu)、迈克尔·奥尔曼(Michael Orman)、亚历克斯·苏皮尔(Alex Soupir)
维护人员:Teemu Daniel Laajala<在utu.fi的teelaa>
引文(从R中输入引文(“策划的PCaData”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“管理PCaData”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“策划的PCaData”)
细节
生物视图 |
CancerData(取消数据),复制编号变化数据,实验数据,实验中心,表达式数据,地理位置,人乳头数据,微阵列数据,前列腺癌数据,RNASeq数据,可复制研究,躯体的 |
版本 |
1.0.0 |
许可证 |
抄送4.0 |
取决于 |
R(>=4.3.0),S4载体(>= 0.23.18),多重分析实验,Ragged实验 |
进口 |
实验中心,批注中心,实用程序,方法,爱尔兰航空公司,统计信息 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/Syksy/curatedPCaData网站 |
错误报告 |
https://github.com/Syksy/curatedPCaData/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。