chiperich.data(芯片丰富数据)

chiperich配套包


生物导体版本:释放(3.19)

chipeenrich包的支持数据。包括预定义的基因集、基因位点定义和可映射性估计。

作者:Ryan P.Welch[aut,cph],Chee Lee[aut],Raymond G.Cavalcante[aut',Kai Wang[cre],Laura J.Scott[th],Maureen A.Sartor[th]

维护人员:Kai Wang<wangdaha at umich.edu>

引文(从R中输入引文(“chiperich.data”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“chiperich.data”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignets(“芯片丰富数据”)
chipenrich数据 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 ChIPSeq公司,表观遗传学,实验数据,功能基因组学,GeneSet扩展,组蛋白修饰,回归
版本 2.28.0
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.5.0)
进口 注释Dbi,生物遗传学,方法,基因组学范围,基因组信息数据库,I范围,阅读器,rtracklayer公司,S4载体,实用程序
系统要求
统一资源定位地址
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建议 仿生风格,开发工具,针织者,市场营销,氧气2,测试那个,政府.db,组织Dm.eg.db,组织博士eg.db,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,组织Rn.eg.db,TxDb(发送日期)。梅勒诺加斯特。UCSC.dm3.ensGene公司,TxDb(发送日期)。梅勒诺加斯特。UCSC.dm6.ensGene公司,TxDb(发送日期)。Drerio.UCSC.danRer10.refGene公司,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因,TxDb(发送日期)。姆穆苏卢斯。UCSC.mm9.known基因,TxDb(发送日期)。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10.known基因,发送数据库。褐家鼠。UCSC.rn4.ensGene公司,TxDb(发送日期)。褐家鼠。UCSC.rn5.refGene公司,TxDb(发送日期)。褐家鼠。UCSC.rn6.ref基因
链接到
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 chipencrich.data_2.28.0.tar.gz公司
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipencrich.data
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:封装/chipenrich.data
包短Url https://bioconductor.org/packages/chipencrich.data/
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