chiperich.data(芯片丰富数据)
chiperich配套包
生物导体版本:释放(3.19)
chipeenrich包的支持数据。包括预定义的基因集、基因位点定义和可映射性估计。
作者:Ryan P.Welch[aut,cph],Chee Lee[aut],Raymond G.Cavalcante[aut',Kai Wang[cre],Laura J.Scott[th],Maureen A.Sartor[th]
维护人员:Kai Wang<wangdaha at umich.edu>
引文(从R中输入引文(“chiperich.data”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“chiperich.data”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignets(“芯片丰富数据”)
细节
生物视图 |
ChIPSeq公司,表观遗传学,实验数据,功能基因组学,GeneSet扩展,组蛋白修饰,回归 |
版本 |
2.28.0 |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=3.5.0) |
进口 |
注释Dbi,生物遗传学,方法,基因组学范围,基因组信息数据库,I范围,阅读器,rtracklayer公司,S4载体,实用程序 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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查看更多
建议 |
仿生风格,开发工具,针织者,市场营销,氧气2,测试那个,政府.db,组织Dm.eg.db,组织博士eg.db,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,组织Rn.eg.db,TxDb(发送日期)。梅勒诺加斯特。UCSC.dm3.ensGene公司,TxDb(发送日期)。梅勒诺加斯特。UCSC.dm6.ensGene公司,TxDb(发送日期)。Drerio.UCSC.danRer10.refGene公司,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg19.known基因,TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因,TxDb(发送日期)。姆穆苏卢斯。UCSC.mm9.known基因,TxDb(发送日期)。姆穆苏卢斯。UCSC.mm10.known基因,发送数据库。褐家鼠。UCSC.rn4.ensGene公司,TxDb(发送日期)。褐家鼠。UCSC.rn5.refGene公司,TxDb(发送日期)。褐家鼠。UCSC.rn6.ref基因 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
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导入我 |
芯片富集 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。