蛋白质组学研究

“Using R and Bioconductor for proteomics data analysis”出版物的配套软件包

生物导体版本：释放（3.19）

此软件包包含用于说明“使用R和Bioconductor进行蛋白质组学数据分析”和“使用R与Biocondator可视化蛋白质组学的数据”手稿的代码。小插曲描述了再现论文中描述的示例和图形所需的代码和数据，以及蛋白质组可视化的功能。它还包含各种功能，用于发现质谱和蛋白质组学的R软件。

作者：劳伦特·加托（aut，cre）、塞巴斯蒂安·吉布（Sebastian Gibb）、弗拉德·佩特尤克（Vlad Petyuk）、托马斯·佩德森·林（Thomas Pedersen Lin）

维护人员：劳伦特·加托

引文（从R中输入引文（“蛋白质组学研究”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“蛋白质组学研究”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignets（“RforProteomics”）

使用R进行蛋白质组学数据分析	HTML格式	R脚本
使用R和Bioconductor可视化蛋白质组数据	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

生物视图	实验数据,质谱数据,可复制研究
版本	1.42.0
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.5），M数据库(>= 2.5.3)
进口	R.utils公司,生物视图,生物技术经理
系统要求
统一资源定位地址	http://lgatto.github.com/RforProteomics（蛋白质组学）/

建议	注释Dbi,rpx公司(>= 2.0.3),DT公司,针织物,rmarkdown公司,仿生风格,毫兹罗,xcms公司,msdata（msdata）,MALDIquant公司(>= 1.12),MALDIquant国外,读取BrukerFlexData,雷迪索,组织MassSpecR,总结性实验,大脑,角色,百帕,政府.db,组织Hs.eg.db,e1071号,生物电阻,R彩色啤酒,ggplot2,重塑2,可发送的,晶格,mz标识,pRoloc公司,pRolocdata公司,MSnID（MSnID）,msms测试,msmsEDA公司,环境保护部,校正图,豆状图,希特普卢斯,gplots（gplots）,维恩图,保护Viz,基因过滤器,巧妙地,额外网格,数字播放器,杂交的,魔法,切割器
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	MS统计质量控制
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	蛋白质组学R_1.42.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RforProteomics（蛋白质组学）
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包装/RforProteomics
包短Url	https://bioconductor.org/packages/RforProteomics网站/
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