MetaScope（元作用域）
用于预处理16S和宏基因组测序微生物组数据的工具和功能
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包包含用于预处理微生物组数据的工具和方法。功能包括文库生成、解复用、比对和微生物鉴定。它在一定程度上是PathotScope 2.0管道的R翻译。
作者：奥布里·奥多姆[aut，cre]
，拉胡尔·瓦尔基[aut]，W.埃文·约翰逊[aut]，霍华德·范
维护人员：奥布里·奥多姆（Aubrey Odom）
引文（从R中输入引文（“MetaScope”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“MetaScope”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“MetaScope”）
细节
| 生物视图 |
实验数据,微生物数据,可复制研究,排序数据 |
| 版本 |
1.4.0 |
| 许可证 |
GPL（>=3） |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
生物文件缓存,生物串,数据表,数字播放器,ggplot2,马格里特,矩阵,多重分析实验,鲁博蒂2,阅读器,拉朗,Rsamtools软件,S4载体,字符串,总结性实验,征税,易怒的,第三年，工具 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/wejlab/metascope网站 https://wejlab.github.io/metascope-docs网站/ |
| 错误报告 |
https://github.com/wejlab/MetaScope/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
微生物,仿生风格,生物格式,基因组范围,I范围,针织物,短绒,普利尔,qlc矩阵,rBLAST公司,rmarkdown公司,R.utils公司,R子阅读,拼写,系统,测试那个,用这个 |
| 链接到 |
|
| 增强功能 |
生物并行 |
| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
|
| 链接到我 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
