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HiBED公司

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生物导体版本:释放(3.19)

使用DNA甲基化对人脑中广泛的细胞类型进行分层反褶积。HiBED反褶积估计了大体积脑组织中多达7种细胞类型(GABA能神经元、谷氨酸能神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞、内皮细胞和基质细胞)的比例。

作者:张泽[cre,aut],卢卡斯·萨拉斯[aut]

维护人员:Ze Zhang<在dartmouth.edu的Ze.Zhang.gr>

引文(从R中输入引文(“HiBED”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“HiBED”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignette(“HiBED”)
HiBED公司 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 实验数据,基因组,人乳头数据,甲基化阵列数据,微阵列数据,包类型数据,组织
版本 1.2.0
许可证 GPL-3型
取决于 R(>=3.5.0)
进口 数字播放器,流排序。鲜血。EPIC公司,易怒的,流排序。DLPFC.450k型,米菲,实用程序,批注中心,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/SalasLab/HiBED
错误报告 https://github.com/SalasLab/HiBED/issues。
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 HiBED_1.2.0.tar.gz公司
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/HiBED
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/HiBED
包短Url https://bioconductor.org/packages/HiBED/
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