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细胞毒性

基于DNA甲基化的分类和回归


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包提供基于DNA甲基化的癌症类型、分子特征和临床结果预测。它为缺失值插补、探针ID转换、模型解释和可视化提供了方便的功能。该软件包链接到我们在ExperimentHub上的模型。该软件包目前支持HM450、EPIC和EPICv2。

作者:周婉婷[aut],雅各布·范纳尔[aut,cre]

维护人员:雅各布·范纳尔(Jacob Fanale)<jfanale at seas.upenn.edu>

引文(从R中输入引文(“CytoMethIC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“CytoMethIC”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“CytoMethIC”)
CytoMethIC用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 CancerData(取消数据),实验数据,实验中心,基因组,甲基化阵列数据,微阵列数据,包类型数据
版本 1.0.0
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.4.0),实验中心
进口 易怒的,utils,stats,工具,芝麻、方法、,sesame数据,生物并行,生物管理器
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/zhou-lab/CytoMethIC
错误报告 https://github.com/zhou-lab/CytoMethIC/issues
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建议 仿生风格,随机森林,测试那个,针织物,rmarkdown公司,e1071号,xgboost公司,珊瑚礁,张量流
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 细胞测定IC_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CytoMethIC
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/CytolMethIC
包短Url https://bioconductor.org/packages/CytoMethIC/
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