锌波
RNA-Seq数据的零膨胀负二项模型
生物导体版本：释放（3.19）
实现了一个通用且灵活的零膨胀负二项模型，可用于提供单细胞RNA-seq数据的低维表示。该模型考虑了零通货膨胀（辍学）、过度分散和数据的计数性质。该模型还考虑了库大小的差异，并可选地考虑了批处理效应和/或其他协变量，从而避免了对数据进行预归一化的需要。
作者：大卫·里索[aut，cre，cph]，斯维特拉娜·格里布科娃[aut]，范妮·佩劳多[aut'，珍妮·菲利佩[aut]
维护人员：Davide Risso<gmail.com上的Risso.Davide>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“zinbwave”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“zinbwave”）
细节
| 生物视图 |
尺寸缩减,基因表达式,免疫肿瘤学,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学 |
| 版本 |
1.26.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.6（R-3.4）（7年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=3.4），方法，总结性实验,单细胞实验 |
| 进口 |
生物并行,softImpute软件，统计，基因过滤器,边缘R,矩阵 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
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| 错误报告 |
https://github.com/drisso/zinbwave/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
针织物,rmarkdown公司,测试那个,矩阵统计,马格里特,scRNA序列,ggplot2,生物反应器,仿生风格,Rtsne公司,设计2,稀疏矩阵统计 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
|
| 导入我 |
河坝的,集群实验,scBFA公司,单细胞TK,数字DLSorteR,空间DDLS |
| 建议我 |
桅杆 |
| 链接到我 |
|
| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
