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纱线

YARN:稳健的多条件RNA-Seq预处理和归一化


生物导体版本:释放(3.19)

使用之前开发的工具组合,加快大型RNA-Seq分析。YARN旨在让用户更容易执行基本的误报质量控制、过滤和条件软件规范化。YARN利用许多生物导体工具和统计技术来解释超大RNA-seq实验中发现的巨大异质性和稀疏性。

作者:Joseph N Paulson[aut,cre],Cho-Yi Chen[aut],Camila Lopes-Ramos[aut',Marieke Kuijjer[aut],John Platig[aut].Abhijeet Sonawane[aut].Maud Fagny[aut4],Kimberly Glass[aut〕,John Quackenbush[aut

维护人员:约瑟夫·保尔森<Paulson.Joseph at gene.com>

引文(从R中输入引文(“纱线”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“纱线”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“纱线”)
YARN:稳健的多问题RNA-Seq预处理和归一化 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 注释,群集,基因表达式,规范化,预处理,质量控制,排序,软件,可视化
版本 1.30.0
在生物导体中 生物C 3.4(R-3.3)(7.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 博科生物
进口 生物反应器,下载器,边缘R,gplots(gplots)、图形、,利马,矩阵统计,预处理核心,阅读器,R彩色啤酒,统计,量子
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 雅尔_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 yarn_1.30.0.zip码
macOS二进制(x86_64) 码-1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) 码-1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yarn网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/纱线
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/yarn网站/
包短Url https://bioductor.org/packages/yarn/
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