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山药

高通量代谢组学工具


生物导体版本:释放(3.19)

用于分析和可视化使用色谱-质谱法获得的高通量代谢组学数据的工具。这些工具以一种能够实现可靠且强大的差分分析的方式对数据进行预处理。这些方法的核心是峰值检测阶段,该阶段同时汇集所有样本的信息。这与其他逐样本检测峰值的方法不同。

作者:莱斯利·米恩[cre,aut],卡斯珀·丹尼尔·汉森

维护人员:莱斯利·米恩(Leslie Myint)<Leslie.Myint at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“yamss”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“yamss”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“yamss”)
yamss用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 质谱学,代谢组学,峰值检测,软件
版本 1.30.0
在生物导体中 生物柴油3.4(R-3.3)(7.5年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.3.0),方法,生物遗传学(>= 0.15.3),总结性实验
进口 I范围,统计,S4载体,息税前利润,矩阵,毫兹罗,数据表,gr设备,利马
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/hansenlab/yamss
错误报告 https://github.com/hansenlab/yamss/问题
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 yamss_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 yamss_1.30.0.zip码
macOS二进制(x86_64) yamss_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) yamss_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yamss
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/山药
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/yamss/
包短Url https://bioconductor.org/packages/yamss/
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