xcms公司
LC-MS和GC-MS数据分析
生物导体版本:释放(3.19)
色谱分离和单光谱质谱数据的处理和可视化框架。从AIA/ANDI NetCDF、mzXML、mzData和mzML文件导入。预处理数据以进行高通量、非目标分析物分析。
作者:Colin A.Smith[aut]、Ralf Tautenhahn[aut'、Steffen Neumann[aut、cre]、保罗·本顿(aut)、克里斯托弗·康利(Christopher Conley)、约翰·雷纳(Johannes Rainer)、迈克尔·威廷[ctb]、威廉·库勒[aut],菲律宾路易[aut],巴勃罗·范根德胡森,卡尔·布鲁纽斯
维护人员:Steffen Neumann在ipb-halle.de>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“xcms”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“xcms”)
细节
生物视图 |
免疫肿瘤学,质谱学,代谢组学,软件 |
版本 |
4.2.3 |
在生物导体中 |
BioC 1.6(R-2.1)或更早(>19.5年) |
许可证 |
GPL(>=2)+文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.0.0),生物并行(>= 1.8.0) |
进口 |
MSn碱基(>= 2.29.3),毫兹罗(>=2.25.3),方法,博科生物,生物遗传学,ProtGenerics公司(>= 1.35.4),晶格,MassSpec小波(>= 1.66.0),S4载体,I范围,总结性实验,MsCoreUtils(MsCore实用程序)(>= 1.15.5),消息功能,理学硕士实验(>= 1.5.4),光谱(>= 1.13.7),进步,jsonlite公司,R彩色啤酒,MetaboCoreUtils(元核心实用程序)(>= 1.11.2) |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/sneumann/xcms |
错误报告 |
https://github.com/sneumann/xcms/issues/new |
查看更多
建议 |
仿生风格,ca工具,针织物(>= 1.1.0),法亚科,msdata(msdata)(>= 0.25.1),网络数据流4,测试那个(>= 3.1.9),迎合,rmarkdown公司,MALDIquant公司,情势图,RANN公司,multtest公司,消息后端管理,信号,mgcv公司 |
链接到 |
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增强功能 |
Rgraphviz公司,rgl公司 |
取决于我 |
摄像机,旗子,首次公开募股,龙虾,元MS,ncGTW公司,法亚科,PtH2O2脂质 |
导入我 |
摄像机,小集团MS,科斯密克 |
建议我 |
俱乐部ID,ms纯度,R银行,msdata(msdata),mtbls2型,蛋白质组学研究,校正过载峰值,环境GCMS,isatabr公司,LCMSQA公司,代谢组学基础,RAMClustR公司 |
指向我的链接 |
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生成报告 |
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程序包档案
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