速度捕捉器
单细胞速度工具包
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包为单细胞RNA-seq数据中的RNA速度计算提供了Bioconductor友好包装器。我们使用basilisk包管理Conda环境，使用zellkonverter包在SingleCellExperiment（R）和AnnData（Python）之间转换数据结构。速度方法生成的信息存储在SingleCellExperiment类的各个组件中。
作者：凯文·鲁·阿尔布雷奇特
，亚伦·伦[aut]夏洛特·索内森，迈克尔·斯塔德勒[aut]
维护人员：Kevin Rue-Albrecht<kevinrue67 at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“velociraptor”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“速度捕捉器”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“速度捕捉器”）
细节
| 生物视图 |
新闻报道,基因表达式,排序,单个单元格,软件 |
| 版本 |
1.14.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.12（R-4.0）（3.5年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
摘要实验 |
| 进口 |
方法、统计信息、，矩阵,生物遗传学,网状的,S4载体,DelayedArray（延迟阵列）,蛇怪,zellkonverter公司,舷窗,单细胞实验,生物并行,BiocSingular公司 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/kevinrue/velociraptor网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/kevinrue/velociraptor/issues |
查看更多
| 建议 |
仿生风格,测试那个,针织物,rmarkdown公司,pkg向下,尖叫声,散射,scRNA序列,Rtsne公司、图形、grDevices、，ggplot2,奶牛场,GGally公司,拼凑,米R |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
OSCA高级 |
| 导入我 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
