差异分区

量化和解释多水平基因表达实验中的变异驱动因素

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“variancePartition”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“variancePartition”）

1） 方差分割分析	HTML格式	R脚本
2） 其他可视化效果	HTML格式	R脚本
3） 随机效应和REML的理论与实践	HTML格式	R脚本
4） 梦想：重复测量设计的差异表达测试	HTML格式	R脚本
5） 错误处理	HTML格式	R脚本
6） 常见问题	HTML格式	R脚本
7） 多元检验	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

细节

生物视图	BatchEffect（批次效果）,差异表达式,表观遗传学,功能基因组学,基因表达式,GeneSet扩展,免疫肿瘤学,微阵列,规范化,预处理,质量控制,RNA序列,回归,软件,转录组学
版本	1.34.0
在生物导体中	生物技术3.2（R-3.2）（8.5年）
许可证	GPL-2型
取决于	R（>=4.3.0），ggplot2,利马,生物并行
进口	MASS（质量）,pbkr试验(>= 0.4-4),lmer测试,矩阵(>= 1.4.0),迭代器,gplots（gplots）,公司,矩阵统计,RhpcBLASctl公司,重塑2,remaCor公司(>= 0.0.15),芬科娃,声光器件,规模,Rdpack公司,爱尔兰航空公司,lme4公司（>=1.1.33），gr设备，图形，博科生物，方法，实用程序，统计信息
系统要求
统一资源定位地址	http://bioconductor.org/packages/variancePartition https://DiseaseNeuroGenomics.github.io/variancePartition网站
错误报告	https://github.com/DiseaseNeuroGenomics/variancePartition/问题

查看更多

建议	仿生风格,针织物,迎合者,rmarkdown公司,边缘R,右旋糖,tximport（最大端口）,tximportData（最大端口数据）,舞会礼服,DESeq2公司,RUnit（运行单位）,奶牛场,快速,天顶,随机反演,生物遗传学,r2glmm（平方毫米）,阅读器
链接到
增强功能
取决于我	梦想家
导入我	麝香葡萄酒,天顶
建议我	GRaNIE公司
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	差异分区_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	差异分区_1.34.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	差异分区_1.34.0.tgz
macOS二进制（arm64）	差异分区_1.34.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/variancePartition网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/variancePartition
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/variancePartition网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/variancePartition网站/
软件包下载报告	下载统计信息