uSORT公司

uSORT:一种自我定义的基因选择排序管道


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包旨在从单细胞RNA-seq数据中揭示固有的细胞进展路径。它包括数据预处理、初步PCA基因选择、初步细胞排序、特征选择、精细细胞排序以及分析后解释和可视化。

作者:刘迈禅、陈浩、陈金淼

维护人员:Hao Chen在immunol.a-star.edu.sg>

引文(从R中输入引文(“uSORT”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“uSORT”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“uSORT”)
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新闻 文本

细节

生物视图 细胞生物学,DNASeq公司,图形用户界面,免疫肿瘤学,RNA序列,软件
版本 1.30.0
在生物导体中 生物化学3.4(R-3.3)(8年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=3.3.0),tcltk
进口 记录仪,矩阵,拉恩,R光谱,VGAM公司,gplots(gplots),平行,普利尔、方法、,集群,博科生物,消防车,生物遗传学,单片眼镜,grDevices,图形,统计,实用程序
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 uSORT_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 uSORT_1.30.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) uSORT_1.30.0.tgz
macOS二进制(arm64) uSORT_1.30.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/uSORT网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/uSORT
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/uSORT网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/uSORT网站/
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