树（treeio）

系统发育树输入输出的基类和函数

生物导体版本：释放（3.19）

“treeio”是一个R包，可以更容易地导入和存储带有相关数据的系统发育树；并将来自不同来源的外部数据与系统发育联系起来。它还支持将具有异构关联数据的系统发育树导出到单个树文件中，并可作为将树与关联数据合并并转换文件格式的平台。

作者：余光创[aut，cre]，Tommy Tsan-Yuk Lam[ctb，ths]，Xuangbin Xu[ctb]、布拉德利·琼斯、凯西·邓恩、泰勒·布拉德利、康斯坦蒂诺斯·盖尔斯

维护人员：Guanghuang Yu（广创语）

引文（从R中输入引文（“treeio”）)以下为：

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“treeio”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“treeio”）

生物视图	对齐,注释,群集,数据导入,数据表示,多序列对齐,系统发育学,软件
版本	1.28.0
在生物导体中	生物活性炭3.5（R-3.4）（7年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=3.6.0）
进口	ape，dplyr，jsonlite，magrittr，methods，rlang，stats，tibble，tidytree（>=0.4.5），utils，yulab.utils（>0.1.1）
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/YuLab-SMU/treeio（开发） https://docs.ropensci.org/treeio网站/（文档） https://www.amazon.com/Integration-Moperation-Visualization-Phylgenetic-Computational-ebook/dp/B0B5NLZR1Z/（书） https://doi.org/10.1093/molbev/msz240（纸）
错误报告	https://github.com/YuLab-SMU/treeio/issues

建议	生物管柱、cli、ggplot2、，ggtree（ggtree），igraph，knitr，rmarkdown，phangorn，prettydoc，purrr，testthat，tidyr，vroom，xml2，yaml
链接到
增强功能
取决于我
导入我	geneplast.数据,ggtree（ggtree）,微生物菌剂工艺,树总结实验
建议我	ggtreeDendro公司,ggtree额外,射频放大器室
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	树-1.28.0.tar.gz
Windows二进制	treeio_1.28.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	树-1.28.0.tgz
macOS二进制（arm64）	树-1.28.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/treeio网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/树
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/treeio网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/treeio网站/
软件包下载报告	下载统计信息