转录记录器
基于转录图的转录分析
生物导体版本:释放(3.19)
基于转录图的转录分析R包,这是一种分析转录组的方法,可将表达值投射到一组有序蛋白质上,基因产物参与同一代谢途径的概率随着序列中两个蛋白质之间距离的增加而指数下降。因此,转录图是全基因组的基因表达谱,为细胞代谢提供了全局视图,同时指示其表达发生改变的基因集。
作者:迭戈·莫利斯[aut,cre],罗德里戈·达尔莫林[aut]
维护人员:迭戈·莫利斯(Diego Morais)<vinx at ufrn.edu.br>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“转录记录仪”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“转录记录仪”)
细节
生物视图 |
群集,差异表达式,基因表达式,GeneSet扩展,图形和网络,免疫肿瘤学,微阵列,网络,RNA序列,软件,系统生物学,转录,可视化 |
版本 |
1.26.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.6(R-3.4)(6.5年) |
许可证 |
GPL(>=2) |
取决于 |
R(>=3.4),方法 |
进口 |
生物反应器,数据表,多斯诺,foreach公司,ggplot2、图形、grDevices、,记录仪,利马,平行,进步,雷德(Rede R),雪,统计,三年,topGO(顶GO) |
系统要求 |
Java运行时环境(>=6) |
统一资源定位地址 |
https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer网站 |
错误报告 |
https://github.com/arthurvinx/transcriptogramer/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。