顶级糖果

最佳自信效果大小

生物导体版本：释放（3.19）

根据置信效应大小对结果进行排序，同时保持错误发现率和错误覆盖率声明率控制。Topconcects是TREAT结果的另一种表示方式，具有改进的可用性，消除了p值，而提供了置信界限。主要应用是差异基因表达分析，提供按置信对数倍变化顺序排列的基因，但它可以应用于任何具有相关标准误差的效应大小集合。

作者：保罗·哈里森

维护人员：保罗·哈里森（Paul Harrison）

引文（从R中输入引文（“topconfects”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“topconpects”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“topcopects”）

生物视图	差异表达式,基因表达式,多重比较,RNA序列,回归,软件,转录组学,mRNA微阵列
版本	1.20.0
在生物导体中	生物技术3.9（R-3.6）（5年）
许可证	LGPL-2.1\|文件许可证
取决于	R（>=3.6.0）
进口	方法、utils、统计信息，断言,ggplot2
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/pfh/topconpects
错误报告	https://github.com/pfh/topconfects/issues网站

建议	利马,边缘R,随机反演,DESeq2公司,灰烬,NBPSeq公司,数字播放器,测试那个,重塑2,第三年,阅读器,组织地址.db,注释Dbi,针织物,市场营销,仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我	GeoTcga数据,威特里克斯
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	顶级糖果_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	顶级糖果_1.20.0.zip
macOS二进制（x86_64）	顶部糖果_1.20.0.tgz
macOS二进制（arm64）	顶部糖果_1.20.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/topconducts网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/topcopects
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/topconpects网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/topconducts网站/
软件包下载报告	下载统计信息