tidy空间实验
将空间实验带入潮流
生物导体版本:释放(3.19)
tidySpatialExperiment在SpatialExperiment包和tidyverse生态系统之间提供了一座桥梁。它创建了一个不可见的层,允许您与一个SpatialExperiment对象进行交互,就像它是一个隐藏的对象一样;支持使用dplyr、tidyr、ggplot2和plotly中的函数。但是,在下面,您的数据仍然是一个SpatialExperiment对象。
作者:威廉·哈奇森,斯特凡诺·曼吉奥拉[aut]
维护人员:威廉·哈奇森(William Hutchison)<Hutchison.w at wehi.edu.au>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“tidySpatialExperiment”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“tidySpatialExperiment”)
细节
生物视图 |
基因表达式,基础设施,RNA序列,排序,单个单元格,软件,空间,转录组学 |
版本 |
1.0.0 |
在生物导体中 |
生物活性碳3.19(R-4.4)(<6个月) |
许可证 |
GPL-3公司 |
取决于 |
R(>=4.3.0),空间实验,tidy单细胞实验 |
进口 |
tt服务,总结性实验,单细胞实验,生物遗传学,矩阵,S4载体、方法、实用程序,pkg配置,易怒的,数字播放器,第三年,ggplot2,马格里特,爱尔兰航空公司,呜呜声,字符串,录像机,潮汐选择,支柱,气候变化指数,范西,生命周期 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/william-hutchison/tidy空间实验 https://william-hutchison.github.io/tidy空间实验/ |
错误报告 |
https://github.com/william-hutchison/tidySpatialExperiment/issues网站 |
查看更多
建议 |
仿生风格,测试那个,针织物,降价,单细胞信号,单个R,散射,尖叫声,记录仪,GGally公司,细胞索引,同上顺序,奶牛场,DropletUtils公司,巧妙地,tidy总结实验 |
链接到 |
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增强功能 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。