系统管道工具
数据可视化工具
生物导体版本：释放（3.19）
systemPipeTools包通过一个增强的数据可视化工具包扩展了广泛使用的systemPipeR（SPR）工作流环境，包括自动化数据可视化以分析差异表达基因（DEG）的实用程序。systemPipeTools通过散点图、层次聚类热图、主成分分析、多维缩放、广义主成分、t-Distributed随机邻域嵌入（t-SNE）以及MA和火山图提供数据转换和数据探索功能。所有这些实用程序都可以与systemPipeR环境的模块化设计集成，使用户可以轻松地将这些功能和/或自定义替换为其他功能。
作者：Daniela Cassol[aut，cre]，Ponmathi Ramasamy[aut]，Le Zhang[aut]，Thomas Girke[aut
维护人员：丹妮拉·卡索尔（Daniela Cassol）
引文（从R中输入引文（“systemPipeTools”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“systemPipeTools”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“systemPipeTools”）
细节
| 生物视图 |
群集,数据导入,差异表达式,实验设计,基础设施,多维缩放,主要组件,质量控制,报告写作,排序,软件 |
| 版本 |
1.12.0 |
| 在生物导体中 |
生物化学3.13（R-4.1）（3年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
|
| 进口 |
DESeq2公司、GGally、Rtsne、，总结性实验，猿，dplyr，ggplot2，ggrest，ggtree（ggtree），glmpca，pheatmap，plotly，tibble，magrittr，DT，统计 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
|
查看更多
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
