系统管道光泽
systemPipeShiny：一个用于工作流管理和可视化的交互式框架
生物导体版本：释放（3.19）
systemPipeShiny（SPS）通过Shiny应用程序提供的多功能图形用户界面扩展了广泛使用的systemPipeR（SPR）工作流环境。这允许非R用户（如实验人员）以交互方式运行许多systemPipeR的工作流设计、控制和可视化功能，而无需了解R。最重要的是，SPS被设计为一个通用框架，用于以直观的方式与其他R包交互。与大多数Shiny应用程序一样，SPS可以在本地计算机上使用，也可以在集中式基于服务器的部署上使用，这些部署可以作为公共web服务进行远程访问，以便将SPR的功能与社区和/或私人数据一起使用。该框架可以集成R/Bioconductor生态系统的许多核心包。SPS当前功能的示例包括：（a）使用易于使用的表格编辑器或文件上传器交互式创建实验设计和元数据；（b） 工作流拓扑的可视化，结合交互式设计工作流的R Markdown预览的自动生成；（d） 访问广泛的数据处理例程；（e） 以及一组可扩展的可视化功能。复杂的视觉结果可以在“Canvas Workbench”上管理，允许用户以高效的方式组织和比较绘图，并结合会话快照功能，以便以后继续工作。当前的预配置可视化示例套件。SPR的模块化设计使其易于在不了解Shiny的情况下设计定制功能，并通过社区的贡献在未来扩展环境。
作者：Le Zhang[aut，cre]，Daniela Cassol[aut]，Ponmathi Ramasamy[aut]，Jinhai Zhang[aut]Gordon Mosher[aut】，Thomas Girke[aut
维护人员：乐章<Le.zhang001，邮箱：email.ucr.edu>
引文（从R中输入引文（“systemPipeShiny”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“systemPipeShiny”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“systemPipeShiny”）
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