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特殊目的地网络

空间分位数归一化


生物导体版本:释放(3.19)

spqn包实现了空间分位数规范化(spqn)。该方法是为了消除由基因表达数据构建的相关矩阵中的平均相关关系而开发的。它可以作为共同表达分析之前的预处理步骤。

作者:Yi Wang[cre,aut],Kasper Daniel Hansen[aut]

维护人员:王毅<gmail.com>上的王毅5

引文(从R中输入引文(“spqn”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“spqn”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“spqn”)
spqn用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 图形和网络,网络推理,规范化,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 生物C 3.11(R-4.0)(4年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R(>=4.0),ggplot2,ggridges公司,摘要实验,生物遗传学
进口 图形、统计、实用程序,矩阵统计
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/hansenlab/spqn
错误报告 https://github.com/hansenlab/spqn/issues
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建议 仿生风格,针织物,rmarkdown公司、工具、,spqn数据(>= 0.99.3),RUnit(运行单位)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 spqn_1.16.0.tar.gz公司
Windows二进制 spqn_1.16.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) spqn_1.16.0.tgz
macOS二进制(arm64) spqn_1.16.0.tgz型
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spqn
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/spqn
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/spqn/
包短Url https://bioconductor.org/packages/spqn/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档