注册打开对于生物20247月24-26日

溢出R

大规模细胞术数据中的溢出补偿


生物导体版本:释放(3.19)

质谱仪中的通道干扰会导致溢出,并可能导致蛋白质标记物的错误计数。我们建立了一个非参数有限混合模型,并使用混合成分估计溢出概率。我们使用期望最大化方法来拟合混合模型。

作者:马可·瓜齐尼[aut,cre],亚历山大·雷萨奇[aut],塞巴斯蒂安·魏奇瓦尔德[aut],克里斯托夫·塞勒[aut]

维护人员:马尔科·瓜齐尼<m.Guazzini在学生.马斯特里赫特大学.nl>

引文(从R中输入引文(“spillR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“spillR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“spiller”)
spillR紫罗兰 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 流式细胞术,免疫肿瘤学,质谱学,预处理,回归,单个单元格,软件,统计方法,可视化
版本 1.0.0
在生物导体中 生物活性碳3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 LGPL-3型
取决于 R(>=4.3.0),总结性实验,催化剂
进口 数字播放器,易怒的,潮汐选择,统计,ggplot2,第三年,spastat.geom公司,S4载体,并行
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 针织物,rmarkdown公司,奶牛场,测试那个(>= 3.0.0),仿生风格,己宾
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 溢出R_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 溢出R_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64) 溢出R_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) 溢出R_1.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spillR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/溢出物
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/spillR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/spillR/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档