空间热图
空间热图
生物导体版本:释放(3.19)
spatialHeatmap软件包提供了在空间解剖图像中可视化细胞、组织和器官特异性分析数据的主要功能。此外,它还为大规模数据挖掘例程以及批量数据和单单元格数据的协同可视化提供了扩展功能。
作者:张建海[aut,trl,cre],张乐[aut],乔丹·海耶斯[aut],布伦丹·贡戈[aut',亚历山大·博罗夫斯基[aut]
维护人员:张建海(Jianhai Zhang)<jzhan067 at ucr.edu>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“空间热图”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“空间热图”)
细节
生物视图 |
ATACSeq公司,基于细胞的分析,细胞生物学,群集,DNASeq公司,数据表示,基因表达式,基因目标,图形和网络,微阵列,网络,排序,单个单元格,软件,空间,组织微阵列,可视化 |
版本 |
2.10.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年) |
许可证 |
艺术-2.0 |
取决于 |
R(>=3.5.0) |
进口 |
数据表,数字播放器,边缘R,基因过滤器,ggplot2,gr导入,网格,额外网格,gplots(gplots),记录仪、方法、,矩阵,rsvg公司,闪亮的,gr设备,图形,ggplotify(图形化),平行,重塑2,散射,舷窗,尖叫声,统计,总结性实验,单细胞实验,闪亮的仪表板,S4载体,spsComps公司(>= 0.3.3.0),易怒的,实用程序,xml语言2 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/jianhaizhang/spatialHeatmap |
错误报告 |
https://github.com/jianhaizhang/spatialHeatmap/issues网站 |
查看更多
建议 |
注释Dbi,av(平均值),生物并行,生物文件缓存,生物遗传学,仿生风格,BiocSingular公司,博科生物,密室,DESeq2公司,右旋糖,DT公司,动态树剪切,flashClust(闪光俱乐部),ggdendro公司,HDF5阵列,html工具,html小部件,kableExtra(额外),针织物,利马,魔法,备忘录,ExpressionAtlas公司,地理查询,组织Hs.eg.db,组织管理例会.db,组织地址.db,组织博士eg.db,组织结构图,中华人民共和国,巧妙地,rmarkdown公司,角色,说唱歌手,RUnit(运行单位),Rtsne公司,rhdf5型,闪亮小工具,闪亮的牛仔裤,闪亮BS,可分类的,修拉,迷你图,spsUtil软件,超高速,UpSetR(升级程序),visNetwork(可视网络),WGCNA公司,xlsx公司,山药 |
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程序包档案
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