空间DE

SpatialDE的R包装

生物导体版本：释放（3.19）

SpatialDE是一种从空间转录组学数据中寻找空间可变基因（SVG）的方法。这个包提供了包装器来使用R中的Python SpatialDE库，使用reticulate和basilisk。

作者：大卫·科尔索，米兰·马尔法特，Lambda Moses[aut]，Gabriele Sales[cre]

维护人员：Gabriele Sales在unipd.it>的销售

引文（从R中输入引文（“spatialDE”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“spatialDE”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“spatialDE”）

生物视图	软件,转录组学
版本	1.10.0
在生物导体中	生物柴油3.14（R-4.1）（2.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.3）
进口	网状的,蛇怪(>= 1.9.10),将死，统计，空间实验、方法、，摘要实验,矩阵,ggplot2,gg排斥,规模,额外网格
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/sales-lab/spatialDE网站 https://bioconductor.org/packages/spatialDE网站/
错误报告	https://github.com/sales-lab/spatialDE/issues

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	空间数据元素_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	空间DE_1.10.0.zip
macOS二进制（x86_64）	空间DE_1.10.0.tgz
macOS二进制（arm64）	空间DE_1.10.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spatialDE网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/spatialDE
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/spatialDE网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/spatialDE网站/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包	源存档