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snpStats(snpStat)

SnpMatrix和XSnpMatrix类和方法


生物导体版本:释放(3.19)

大型SNP关联研究的分类和统计方法。这扩展了早期的snpMatrix包,允许基因型的不确定性。

作者:大卫·克莱顿(David Clayton)<dc208 at cam.ac.uk>

维护人员:大卫·克莱顿(David Clayton)<dc208 at cam.ac.uk>

引文(从R中输入引文(“snpStats”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“snpStats”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“snpStats”)
数据输入 PDF格式 R脚本
Fst公司 PDF格式 R脚本
插补和荟萃分析 PDF格式 R脚本
LD统计 PDF格式 R脚本
主成分分析 PDF格式 R脚本
snpMatrix差异 PDF格式
snpStats简介 PDF格式 R脚本
TDT测试 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 遗传变异性,微阵列,SNP公司,软件
版本 1.54.0
在生物导体中 生物技术2.8(R-2.13)(13年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=2.10.0),生存,矩阵,方法
进口 图形、grDevices、stats、utils、,生物遗传学,zlibbico公司
系统要求
统一资源定位地址
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 snpStats_1.54.0.tar.gz
Windows二进制 snpStats_1.54.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) snp状态_1.54.0.tgz
macOS二进制(arm64) snpStats_1.54.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snpStats网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/snpStats
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/snpStats网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/snpStats网站/
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