快照计数

R/Bioconductor包，用于与Snaptron接口，以快速查询表达式计数

生物导体版本：释放（3.19）

snapcount是Snaptron网络服务的客户端接口，支持按基因名称或基因组区域进行查询。结果包括来源于RNA-seq样品比对的原始表达计数和/或每个样品跨一个或多个区域/基因的各种汇总表达测量（例如拼接的百分比）。

作者：罗恩·查尔斯

维护人员：罗恩·查尔斯（Rone Charles）<rcharle8 at jh.edu>

引文（从R中输入引文（“snapcount”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“快照”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“快照”）

生物视图	新闻报道,数据导入,基因表达式,RNA序列,排序,软件
版本	1.16.0
在生物导体中	生物柴油3.11（R-4.0）（4.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=4.0.0）
进口	R6级,高温气冷堆,爱尔兰航空公司,呜呜声,jsonlite公司,断言,数据表,矩阵,马格里特、方法、，字符串，统计，I范围,基因组范围,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/langmead-lab/snapcount网站
Bug报告	https://github.com/langmead-lab/snapcount/issues

建议	生物技术经理,位64,冠状病毒,针织物,针织物(>= 1.6),开发工具,仿生风格(>= 2.5.19),rmarkdown公司(>= 0.9.5),测试那个(>= 2.1.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	快照_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	snapcount_1.16.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	快照_1.16.0.tgz
macOS二进制（arm64）	快照_1.16.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snapcount网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/快照计数
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/snapcount网站/
包短Url	https://bioductor.org/packages/snapcount/
软件包下载报告	下载统计信息