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草图R

python子采样/绘制算法的R接口


生物导体版本:释放(3.19)

为在python包中实现的各种子采样算法提供R接口。目前,实现了geosketch和scSampler-python包的接口。此外,它还提供诊断图来评估子采样。

作者:夏洛特·索尼森,迈克尔·斯塔德勒[aut],弗里德里希·米歇生物医学研究所

维护人员:夏洛特·索尼森

引文(从R中输入引文(“sketchR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“sketchR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“草图”)
草图R HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 单个单元格,软件
版本 1.0.0
在生物导体中 生物活性碳3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 MIT+文件许可证
取决于
进口 蛇怪,博科生物,DelayedArray(延迟阵列),数字播放器,ggplot2、方法、,网状的,爱尔兰航空公司,规模,统计信息
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/fmicompbio/sketchR
错误报告 https://github.com/fmicompbio/sketchR/issues
查看更多
建议 rmarkdown公司,针织物,测试那个(>= 3.0.0),TENxPBMC数据,舷窗,尖叫声,散射,单个R,细胞索引,奶牛场,总结性实验,海滩.hdf5,仿生风格,生物管理器,单细胞实验
链接到
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取决于我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 草图R_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 草图R_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64) 草图R_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) 草图R_1.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sketchR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/sketchR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/sketchR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/sketchR/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档