简单丰富

简化函数丰富结果

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包实现了一种新的聚类算法“二元切割”，用于聚类函数项的相似矩阵。它还提供了可视化、总结和比较聚类的功能。

作者：祖光顾[aut，cre]

维护人员：祖光顾<z.Gu at dkfz.de>

引文（从R中输入引文（“simplifyEnrichment”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“simplifyEnrichment”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“simplifyEnrichment”）

生物视图	群集,GO（开始）,GeneSet扩展,软件,可视化
版本	1.14.0
在生物导体中	生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.6.0），生物遗传学，网格
进口	GOSemSim公司,复杂热图(>= 2.7.4),绕圈子,GetoptLong（获取长）,消化,tm公司,政府.db,组织Hs.eg.db,注释Dbi,砰地关上、方法、，线索、grDevices、graphics、stats、utils、，代理C,矩阵,集群(>= 1.14.2),色彩空间,全局选项(>= 0.1.0)
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/jokergoo/simplifyEnrichment网站 https://simplifyEnrichment.github.io网站

建议	针织物,ggplot2,奶牛场,麦克卢斯特,ap集群,MCL公司,聚类算法,记录仪,额外网格,动态树剪切,测试那个,网格图形,clusterProfiler（群集探查器）,msigdbr公司,剂量,出生日期.db,反应.db,柔性集群,生物技术经理,交互式复杂热图(>= 0.99.11),闪亮的,闪亮的仪表板,可乐,胡6800.db,rmarkdown公司,基因过滤器,网格文本,消防车
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我	可乐,交互式复杂度热图,帕雷格,西蒙娜,scITD公司
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	simplifyEnrichment_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	simplifyEnrichment_1.14.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	简化浓缩_1.14.0.tgz
macOS二进制（arm64）	简单丰富_1.14.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/simplifyEnrichment网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/simplifyEnrichment
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/simplifyEnrichment网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/simplifyEnrichment网站/
软件包下载报告	下载统计信息