签名搜索

结合功能富集分析的基因表达搜索环境

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包实现了用于执行基因表达签名（GES）搜索的算法和数据结构，并随后使用专门的富集方法对结果进行功能解释。

作者：段玉柱[aut]、布伦丹·贡戈[cre，aut]和托马斯·吉尔克[aut'

维护人员：Brendan Gongol<加州大学教育学院bgong001>

引文（从R中输入引文（“签名搜索”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“signatureSearch”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“签名搜索”）

生物视图	新闻报道，差异表达式，GO（开始），基因表达式，KEGG公司，网络丰富，排序，软件
版本	1.18.0
在生物导体中	生物技术3.10（R-3.6）（4.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.2.0），卢比，总结性实验，组织Hs.eg.db
进口	注释Dbi，ggplot2，数据表，实验中心，HDF5阵列，马格里特，RSQ网站，数字播放器，fgsea公司，规模、方法、，q值，统计，实用程序，重塑2，visNetwork（可视网络），生物并行，快速比赛，反应.db，矩阵，clusterProfiler（群集探查器），阅读器，剂量，rhdf5型，GSEA基地，延迟阵列，生物遗传学，易怒的
系统要求	C++11语言
统一资源定位地址	https://github.com/yduan004/signature搜索/
错误报告	https://github.com/yduan004/signatureSearch/issues

建议	针织物，测试那个，市场营销，仿生风格，签名搜索数据，DT公司
链接到	卢比
增强功能
取决于我
导入我	DFD公司
建议我
链接到我
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	签名搜索_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	签名搜索_1.18.0.zip
macOS二进制（x86_64）	签名搜索_1.18.0.tgz
macOS二进制（arm64）	签名搜索_1.18.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/signatureSearch网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包裹/签名搜索
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/signature搜索/
包短Url	https://bioductor.org/packages/signatureSearch/
软件包下载报告	下载统计信息