七桥

七桥平台API客户端和R中的通用工作流语言工具生成器


生物导体版本:释放(3.19)

七桥平台API的R客户端和实用程序,从癌症基因组云到其他七桥支持的平台。

作者:菲尔·韦伯斯特[aut,cre],索内尔·科克[aut],南晓[aut],尹腾飞[aut].杜珊·兰杰洛维奇[ctb],艾米尔·杨[ctb].维瑟拉[cph,fnd]

维护人员:菲尔·韦伯斯特(Phil Webster)

引文(从R中输入引文(“sevenbridges”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“sevenbridges”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“七桥”)
七桥API R客户端完整指南 HTML格式 R脚本
创建Docker容器和命令行界面(使用docopt) HTML格式 R脚本
描述并执行R中的CWL工具/工作流 HTML格式 R脚本
通过数据浏览器和数据集API在CGC上查找数据 HTML格式 R脚本
IDE容器:RStudio Server、Shiny Server等 HTML格式 R脚本
主教程:将R用于癌症基因组云 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,软件,第三方客户
版本 1.34.0
在生物导体中 生物多样性3.3(R-3.3)(8.5年)
许可证 Apache许可证2.0 |文件许可证
取决于 方法、utils、stats
进口 高温气冷堆,jsonlite公司,山药,对象属性,字符串,S4载体,docopt文件,卷曲,乌伊德,数据表
系统要求
统一资源定位地址 https://www.sevenbridges.com https://sbg.github.io/sevenbridges-r/ https://github.com/sbg/sevebridges-r
错误报告 https://github.com/sbg/sevenbridges-r/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 七桥_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 七桥_1.34.0.zip
macOS二进制(x86_64) 七桥_1.34.0.tgz
macOS二进制(arm64) 七桥_1.34.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sevenbridges网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sevenbridges
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/sevenbridges网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/sevenbridges网站/
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