七摄氏度
通过CTCF基序上ChIP-seq的相关性进行计算染色体构象捕获
生物导体版本：释放（3.19）
染色质环是真核生物基因组的一个基本特征，它可以使调控序列，如增强子或转录因子结合位点，与调控的靶基因在物理上非常接近。在这里，我们提供了sevenC，这是一个R包，它使用来自ChIP-seq的蛋白质结合信号和序列基序信息来预测染色质循环事件。与环锚紧密结合的蛋白质的交叉链接会在两个锚位点产生ChIP-seq信号。这些信号用于CTCF基序对，以及它们之间的距离和方向，以预测它们是否相互作用。由此产生的染色质环可用于将增强子或转录因子结合位点（例如ChIP-seq峰）与受调控的靶基因关联。
作者：乔纳斯·伊本·塞勒姆[aut，cre]
维护人员：乔纳斯·伊本·塞勒姆（Jonas Ibn-Salem）
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“sevenC”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
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细节
| 生物视图 |
注释,ChIPSeq公司,ChIP芯片,分类,新闻报道,DNA3D结构,数据导入,表观遗传学,功能基因组学,HiC公司,回归,软件 |
| 版本 |
1.24.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.7（R-3.5）（6年） |
| 许可证 |
GPL-3型 |
| 取决于 |
R（>=3.5），交互集(>= 1.2.0) |
| 进口 |
rtracklayer公司(>= 1.34.1),生物遗传学(>= 0.22.0),基因组信息数据库(>= 1.12.2),基因组范围(>= 1.28.5),I范围(>= 2.10.3),S4载体(>= 0.14.4),读数器(>= 1.1.0),呜呜声(>= 0.2.2),数据表(>= 1.10.4),靴子（>=1.3-20），方法（>=3.4.1） |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/ibn-salem/sevenC |
| 错误报告 |
https://github.com/ibn-salem/sevenC/issues网站 |
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程序包档案
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