芝麻

DNA甲基化珠芯片的理性逐步分析


生物导体版本:释放(3.19)

用于分析Illumina Infinium DNA甲基化阵列的工具。SeSAMe提供了支持多代Infinium DNA甲基化BeadChips分析的实用程序,包括预处理、质量控制、可视化和推断。SeSAMe具有准确的检测调用、对种族、性别的智能推断和高级质量控制程序。

作者:周婉婷[aut,cre]丁武斌、戈德堡、莫耶、巴恩斯、特里奇、沈慧

维护人员:周婉婷<周婉婷在gmail.com>

引文(从R中输入引文(“芝麻”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“芝麻”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“芝麻”)
0.基本用法 HTML格式 R脚本
1.质量控制 HTML格式 R脚本
2.非人形阵列 HTML格式 R脚本
3.建模 HTML格式 R脚本
4.数据推断 HTML格式 R脚本
5.了解您的CG HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 DNA甲基化,甲基化阵列,预处理,质量控制,软件
版本 1.22.2
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(6年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.3.0),sesame数据
进口 绘图,生物并行,实用程序,方法,字符串,阅读器,易怒的,MASS(质量),小麦图(>= 0.2.0),基因组范围,I范围,网格,预处理核心,S4载体,ggplot2,生物文件缓存,基因组信息Db,统计,总结性实验,数字播放器,重塑2
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/zwdzwd/sesame网址
错误报告 https://github.com/zwdzwd/sesame/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 sesame_1.22.2.tar.gz
Windows二进制 sesame_1.22.2.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 塞萨梅_1.22.2.tgz
macOS二进制(arm64) 塞萨梅_1.22.2.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/芝麻
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/芝麻
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/sesame网站/
包短Url https://bioductor.org/packages/芝麻/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包 源档案