scviR公司

从R到scvi-tools的实验推断

生物导体版本：释放（3.19）

这个包定义了从R到scvi-tools的接口。一个小插曲贯穿了totalVI教程，用于分析CITE-seq数据。另一个小插曲将OSCA书第12章的输出与基于totalVI量化的类似输出进行了比较。未来的工作将涉及scvi-tools的其他组件，重点是建立对基于变分自动编码器的概率方法的理解。

作者：文森特·凯里[aut，cre]

维护人员：文森特·凯里在channing.harvard.edu>

引文（从R中输入引文（“scviR”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“scviR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“scviR”）

比较totalVI和OSCA图书CITE-seq分析	HTML格式	R脚本
R中的scvi-tools CITE-seq教程，使用序列化的教程组件	HTML格式	R脚本
scviR：连接生物导体和scvi-tools的R包	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式

生物视图	数据导入,基础设施,单个单元格,软件
版本	1.4.0
在生物导体中	生物柴油3.17（R-4.3）（1年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.3），蛇怪,闪亮的,单细胞实验
进口	网状的,生物文件缓存，实用程序，情势图,摘要实验,S4载体,利马,散射，统计，矩阵泛型
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/vjcitn/scviR
错误报告	https://github.com/vjcitn/scviR/issues网站

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	scviR_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制（x86_64）
macOS二进制（arm64）	scviR_1.4.0.tgz格式
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scviR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/scviR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/scviR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/scviR/
软件包下载报告	下载统计信息