附表
单细胞组学数据的Hexbin图
生物导体版本:释放(3.19)
为存储在单细胞组学数据(如SingleCellExperiment)中的变量和维度缩减构建十六进制图。本包中使用的想法是基于丹·卡尔、尼古拉斯·莱温·科、马丁·梅克勒和托马斯·伦雷的出色工作。
作者:Saskia Freytag[aut,cre],Wan Cheng Tang[ctb],Zimo Peng[ctb].黄景秀[ctb'
维护人员:Saskia Freytag<Freytag.s at wehi.edu.au>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“schex”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“schex”)
细节
生物视图 |
数据导入,尺寸缩减,免疫肿瘤学,排序,单个单元格,软件,可视化 |
版本 |
1.18.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.10(R-3.6)(4.5年) |
许可证 |
GPL-3型 |
取决于 |
单细胞实验(>= 1.7.4),ggplot2(>= 3.2.1) |
进口 |
己宾,统计信息,方法,集群,数字播放器,熵,gg力,网格,爱尔兰航空公司,凹地人 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/SaskiaFreytag/schex网站 |
错误报告 |
https://github.com/SaskiaFreytag/schex/issues网站 |
查看更多
建议 |
gg排斥,针织物,rmarkdown公司,测试那个(>= 2.1.0),覆盖(covr),TENxPBMC数据,散射,修拉,闪亮的仪表板,iSEE公司,记录仪,尖叫声,易怒的,舷窗 |
链接到 |
|
增强功能 |
|
取决于我 |
|
导入我 |
scTensor公司,scTGIF公司 |
建议我 |
|
指向我的链接 |
|
生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。