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附表

单细胞组学数据的Hexbin图


生物导体版本:释放(3.19)

为存储在单细胞组学数据(如SingleCellExperiment)中的变量和维度缩减构建十六进制图。本包中使用的想法是基于丹·卡尔、尼古拉斯·莱温·科、马丁·梅克勒和托马斯·伦雷的出色工作。

作者:Saskia Freytag[aut,cre],Wan Cheng Tang[ctb],Zimo Peng[ctb].黄景秀[ctb'

维护人员:Saskia Freytag<Freytag.s at wehi.edu.au>

引文(从R中输入引文(“schex”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“schex”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“schex”)
Seurat_to_SCE公司 HTML格式 R脚本
使用复选框 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,尺寸缩减,免疫肿瘤学,排序,单个单元格,软件,可视化
版本 1.18.0
在生物导体中 生物技术3.10(R-3.6)(4.5年)
许可证 GPL-3型
取决于 单细胞实验(>= 1.7.4),ggplot2(>= 3.2.1)
进口 己宾,统计信息,方法,集群,数字播放器,,gg力,网格,爱尔兰航空公司,凹地人
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/SaskiaFreytag/schex网站
错误报告 https://github.com/SaskiaFreytag/schex/issues网站
查看更多
建议 gg排斥,针织物,rmarkdown公司,测试那个(>= 2.1.0),覆盖(covr),TENxPBMC数据,散射,修拉,闪亮的仪表板,iSEE公司,记录仪,尖叫声,易怒的,舷窗
链接到
增强功能
取决于我
导入我 scTensor公司,scTGIF公司
建议我
指向我的链接
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 附表_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 schex_1.18.0.zip格式
macOS二进制(x86_64) 附表_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) 计划1.18.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/schex
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/schex
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/schex网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/schex/
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