scRNAseq应用程序

单细胞RNAseq Shiny应用程序包


生物导体版本:释放(3.19)

scRNAseqApp是一个Shiny应用程序包,用于单细胞数据的交互式可视化。它是源自ShinyCell的增强版本,经过重新打包以容纳多个数据集。该应用程序使用户能够同时可视化包含各种类型信息的数据,便于进行全面分析。此外,它还包括一个用户管理系统,用于管理不同用户的数据库可访问性。

作者:欧建宏[aut,cre]

维护人员:欧建宏(Jianhong Ou)<杜克教育学院的欧建宏>

引文(从R中输入引文(“scRNAseqApp”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“scRNAseqApp”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“scRNAseqApp”)
scRNAseqApp小品 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 RNA序列,单个单元格,软件,可视化
版本 1.4.0
在生物导体中 生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.3.0)
进口 围巾,bslib数据库,绕圈子,复杂热图,数据表,数据库接口,DT公司,基因组范围,基因组信息Db,ggdendro公司,gg力,ggplot2,gg排斥,ggridges公司,gr设备,网格,额外网格,html工具,I范围,jsonlite公司,马格里特、方法、,拼凑,巧妙地,R彩色啤酒,参考管理器,rhdf5型,Rsamtools软件,RSQ网站,rtracklayer公司,S4载体,规模,加密,修拉,Seurat对象,闪亮的,闪光帮助者,闪耀经理人,弹弓,单细胞实验,可分类的、统计数据、工具,xfun游戏,xml语言2,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/jianhong/scRNAseqApp网站
Bug报告 https://github.com/jianhong/scRNAseqApp/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 scRNAseqApp_1.4.0.tar.gz代码
Windows二进制 scRNAseqApp_1.4.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) scRNAseqApp_1.4.0.tgz
macOS二进制(arm64) scRNAseqApp_1.4.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scRNAseqApp
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:软件包/scRNAseqApp
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/scRNAseqApp网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/scRNAseqApp/
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