scMitoMut公司
单细胞线粒体突变分析工具
生物导体版本：释放（3.19）
该软件包用于使用单细胞测序数据分析线粒体突变，如scRNASeq和scATACSeq（最好是后者，因为RNA编辑问题）。它包括变异过滤和可视化功能。未来，可视化工具将成为一个独立的包。突变过滤是通过拟合统计模型来解释各种噪声源，包括PCR错误、测序错误、线粒体DNA采样和/或异质性动力学。该模型测试了观察到的细胞内某个基因座的等位基因频率是否可以用噪声模型来解释。如果不是，我们将其归类为突变。此分析的输入是等位基因频率。噪声模型由三个独立的模型组成：二项式、二项式混合模型和贝塔-二项式模型。
作者：孙文杰[cre，aut]
，莱拉·佩里
维护人员：孙文杰<孙文杰在gmail.com>
引文（从R中输入引文（“scMitoMut”）)以下为：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“scMitoMut”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“scMitoMut”）
细节
| 生物视图 |
预处理,排序,单个单元格,软件 |
| 版本 |
1.0.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.19（R-4.4）（<6个月） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
数据表,卢比,马格里特,普利尔,字符串，utils，stats，方法，ggplot2,情势图,zlibbico公司,R彩色啤酒,rhdf5型,阅读器，并行，gr设备 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
http://github.com/wenjie1991/scMitoMut |
| 错误报告 |
https://github.com/wenjie1991/scMitoMut/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
